1905年受
美以美会派遣，前往中国江西省南昌传教。次年发生南昌教案，胡遵理逃离南昌，到九江任诺立女书院校长。1920年，她与留美回国的中国女医生
石美玉脱离信仰已经转变成为“现代派”的
美以美会，从九江来到上海，在
南市制造局路639号创立了伯特利教会和伯特利医院（今上海市第九医院），以后又陆续增设
伯特利中学、
伯特利神学院、伯特利孤儿院[1]。1930年代，曾经每年组成全国巡回布道团，成员中著名的有宋尚节和
计志文，影响很大。
1937年，
淞沪会战爆发，
伯特利神学院迁往香港九龙嘉林边道，医院迁往
上海法租界内的白赛仲路（今
复兴西路），胡遵理和
石美玉则赴美国退休定居。1951年11月29日，胡遵理在美国去世，享年77岁。