联会紊乱就是减数分裂前期染色体不能正常配对，无法形成有生殖效应的配子。

正常情况下联会时同源染色体配对，然后要把同源染色体分开，若同源染色体为偶数条则可以平均分开，但三倍体的同源染色体是三条，即一种形态的染色体有三条，没有办法平均分开，即形成联会紊乱，减数分裂不能正常进行，所以不能形成配子，无法形成种子。

异源二倍体也会发生联会紊乱。

比如，萝卜和甘蓝杂交得到的种子一般不育。因为细胞减数分裂产生生殖细胞时，萝卜的染色体只和萝卜的染色体联会，甘蓝的染色体只和甘蓝的染色体联会，萝卜的染色体和甘蓝的染色体无法联会，无法产生生殖细胞，所以后代不育，但有的因某些因素比如射线照射，使用秋水仙素在有丝分裂时抑制纺锤体形成，或者其他人为或自然因素，导致染色体加倍，就可以与各自的染色体联会，可以产生生殖细胞，自然就可育了。