在生产上的应用主要是堆积浸取或地下浸取含碱性脉石少的低品位次生硫化铜矿；地下浸取采矿后残留在采场内的
铀矿通过细菌对矿石的作用，把矿物中不溶性的金属化合物变成可溶性的化合物，再用一般湿法冶金方法从溶液中进行回收的过程,又称为微生物冶金或细菌采矿,也曾称为细菌冶金。能使用的微生物有许多种，在生产上已应用的有
氧化亚铁硫杆菌。此菌在硫化矿床酸性矿水内，只需简单的
无机营养物便能生活，能在酸性条件下把
硫酸亚铁或黄铁矿氧化为硫酸高铁。酸性硫酸高铁是一种强氧化
浸取剂，能与矿石中的许多矿物进行化学反应，使金属成为硫酸盐。
细菌浸取在生产上的应用主要是：堆积浸取或地下浸取含碱性脉石少的低品位次生硫化铜矿；地下浸取采矿后残留在采场内的
铀矿，如中国安徽铜官山和湖南水口山等矿区曾采用细菌浸取；某些铜锌精矿用细菌法搅拌浸取，也接近工业应用；对砷钴矿的钴及高硫锰矿的锰，浸取效果也很显著。细菌浸取有一定局限性，如浸取周期长、环境温度要适宜等，因此它的应用受到一定限制，是一个发展中的课题。