红旗屯是1821年设立的地名。

因红旗屯位于团山子西南侧，在清朝时此地住的全是满族人，属于正红旗，且以“关”姓为多，因而这里被称为红旗屯，故而得名。

清道光（1821）年间，满族较多的地方，都是旗人故起名红旗屯。1948年土改建政后，隶属于东环村。1956年合作社时期，隶属于东凤管理区。1960年人民公社时期，隶属于东环大队。1984年撤社建乡时，隶属于东环村村民委员会。2010年阿城区山水新城生态园区建设，被全部动迁。