生物系统论和
实验、计算与工程方法整合的生物系统研究,涉及纳米技术、生物计算和
转基因技术的综合,包括分子系统、细胞系统、器官系统和生态系统等层次生物系统的生态学、生理学、遗传学等及其医学、工程应用研究。
系统生物科学或系统
生命科学,简称系统生物学(systems biology),包括,系统生态学(50-60年代)、系统生理学(70-80年代)和系统遗传学(90年代-)以及分子系统生物学(1989年国际生物化学系统论与计算机数学模型会议 - 即,第1届国际分子系统生物学大会)等。1999年中国
曾邦哲在国际上倡导
计算生物学家和
实验生物学家合作,从分子、细胞到器官、生态等系统的“系统论和实验(experimental)、计算(computa)方法整合研究
生物系统”的现代系统生物学 - 2003年国际系统生物学界基本形成共识的概念。
实验方法与系统方法构成科学研究的基本方法,系统生物科学是系统科学和生物实验技术、计算机科学整合的生物系统研究,包括,生物系统的理论和生物系统的技术。
维纳与
香农从动物与通讯行为的研究中提出控制论与信息论,热物理学家布里渊提出“负熵”是信息的概念,
系统科学(包括控制论、信息论)根源于
生命科学的有机体哲学思维,发展了计算机科学而又应用于
生物科学。
系统
生物科学,最初开创于贝塔郎菲的一般系统理论与理论生物学。
艾根的
超循环理论发展了
细胞、生物化学与分子层次的系统论。1924~1928年贝塔郎菲(L.Von.Bertalanffy)多次发表
一般系统论的文章,阐述生物学中有机体概念,提出把有机体当作一个整体或系统来研究,1950年发表《物理学和生物学中的开放系统理论》。最早在1958年Parry J.B.有关个性心理学的工业文述中出现“systems psychology”名词,还1929年发表了Edward B. Titchener的
系统心理学(systematic psychology)文稿。1993年Zieglgansberger W和Tolle TR发表神经系统疾病研究的论文中系统生物学(Systems Biology)词汇可检索于美国
NIH的Pub-Med文献数据库。1968年系统论与生物学(systems theory and biology)国际会议召开,1979年Joël de Rosnay的著作《The Macroscope》有非常明晰与现代的论述应用系统方法的生物学研究。1989年在美国召开的生物化学系统论与生物数学国际会议探讨了
计算生物学模型研究。第10届国际分子系统生物学会议,确立贝塔郎菲为系统生物学先驱,贝塔郎菲开创的
生物系统模型至今仍然很现代。
19世纪是实验生物学(生态、生理与遗传)和实验医学、生物技术的学科形成,20世纪是
实验生物学的迅速发展和系统生物学的形成,自20世纪60年代,
系统生态学(systems ecology, Van Dyne GM.1966)、系统生理学(systems physiology, Sagawa K.1973),以及
系统生物医学(system biomedicine, Kamada T.1992、
系统医学(systems medicine & pharmacy, Zeng BJ.1992年4月-1995年11月)、
系统生物工程(system bio-engineering, Zeng BJ.1994年6月)与
系统遗传学(system genetics, Zeng BJ.1994年11月提出概念与中英文词汇)的概念先后发表。总称为系统生物科学或简称系统生物学 - 21世纪伊始重新提出而迅速兴起成为了主流科学。
系统生物科学的发展,经历了(1)生态系统与动物行为(60-70年代)、(2)生理系统与
神经科学(70-80年代)与(3)遗传系统与
胚胎发育(90年代,Zeng BJ.提出)时期,遗传学从染色体行为的细胞遗传学、基因表达信息流的分子遗传学,发展到了系统遗传学的细胞发生信号传导与基因
调控网络研究。1994年5月曾(杰)邦哲(Zeng BJ)《结构论-泛进化论》,阐述了生物系统综合(synthetic)理论的1)结构整合(integrative)、(2)调适稳态与3)层级建构(constructive)规律,并于90年代中西医学与哲学、
系统学探讨中提出了系统医药学(Zeng BJ,1992)与系统生物工程(Zeng BJ,1994)等概念。20世纪未,细胞信号传导与基因调控的研究与系统论方法的结合,进入了分子细胞层次的系统生物科学研究与发展时期。
中科院
曾邦哲(Zeng BJ)于1996年主办第1届国际转基因动物学术研讨会(秘书长),报告了生物系统论与生物工程、基因组进化与生物体发育
自组织系统理论,以及
输卵管生物反应器等,并于1999年初在德国建立系统生物科学与工程网(英文)及筹备WABSE协会与国际会议等(1999年10月Nature和12月Kybernetes),定义生物系统理论与实验、计算(computational)、工程方法的生物系统分析(biosystem analytics)与人工生物系统(artificial biosystem)和分子生物学与计算机科学整合的研究。
2000年同年,日本Kitnano和Tomita举办国际系统生物学会议,美国Hood建立系统生物学研究所,美国Kool重新定义合成生物学为基于系统生物学的基因工程,最初于1980年Hobom B.提出表述
基因重组技术的合成生物学概念。2007年北野宏明(Kinano)阐释系统生物学是在分子生物学层次的重新兴趣,2008年胡德(Hood)也解释为现代系统生物学 -
分子生物技术和
生物信息技术等带来实验方法的进展。随着化学生物学、
计算生物学、合成生物学的发展,计算机数学建模、全基因人工合成和高通量芯片组学(omics)等
生物技术,构成了系统生物科学发展的技术基础 -
系统生物技术(systems biotechnology)。
21世纪伊始,刊物Nature、Science发表系统生物学、
合成生物学等专刊,终于进入了系统生物科学全球化时代。系统生物学(狭义)、合成生物学、
系统遗传学、系统医学与系统生物工程等,构成系统生物科学(广义)5大核心学科群。系统生物学与合成生物学偏向于系统研究的方法与技术发展,系统遗传学着重于生物发育与遗传进化的机理研究,系统医学与
系统生物工程致力于医疗与生物产业化的应用与开发。