简并
引物是指代表编码单个
氨基酸所有不同
碱基序列可能性引物的混合物。
PCR为了增加
特异性,可以参考
密码子使用表,根据不同生物的碱基使用偏好,减少
简并性。
简并度越低,产物特异性越强,设计引物时应尽量选择简并性小的氨基酸,并避免引物3’末端简并。
核苷酸链中除出现正常的A、T、G、C四种
碱基符号外还出现如R、Y、M、K等其它字母(其中R=
A/G,Y=C/T,M=A/C,K=G/T,S=C/G,W= A/T,H= A/C/T,B= C/G/T,V=A/C/G, D=A/G /T,N=A/C/G/T)。