《医学争鸣》创刊于1980年，是由第四军医大学主管、主办的学术期刊。

1980年，《第四军医大学学报》创刊，刊期为季刊。

1987年，该刊刊期由季刊改为双月刊。

1999年，该刊刊期由双月刊改为月刊。

2001年，该刊刊期由月刊改为半月刊。

2010年，更名为《医学争鸣》，刊期改为双月刊。

2014年12月，该刊成为中国原国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

《医学争鸣》主要报道医学学术方面的各种看法和观点，注重理性的交锋、实证的研讨和冷静的争论。

《医学争鸣》主要有名家论坛、专家述评、医学假说、医学伦理、医学观察、医海探秘、医疗改革、医患关系、医德教育、医海拾贝、学术探讨、学术争鸣、发明与发现、观点与视角等栏目。

据《医学争鸣》2020年第3期期刊内页显示，《医学争鸣》编委会有顾问82人。

据2020年8月《医学争鸣》官网显示，《医学争鸣》编辑部有编辑5人。

据2020年8月16日中国知网显示，《医学争鸣》共出版文献18071篇。

据2020年8月16日万方数据知识服务平台显示，《医学争鸣》共载文1181篇、基金论文量为494篇。

《医学争鸣》是北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊（1992年第一版，1996年第二版，2000年版，2004年版，2008年版，2011年版，2014年版），被CA化学文摘（美）（2014）、JST日本科学技术振兴机构数据库（日）（2018）、中国知网、万方数据服务平台等收录。

据2020年8月16日中国知网显示，《医学争鸣》总被下载1705296次、总被引84484次，（2019版）复合影响因子为0.639、（2019版）综合影响因子为0.548。

据2020年8月16日万方数据知识服务平台显示，《医学争鸣》被引量为2354次、下载量为291次；据2018年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《医学争鸣》影响因子为0.83，在全部统计源期刊（6719种）中排第2223名。。

《医学争鸣》是军队双奖期刊、《Caj-cd规范》获奖期刊。

2012年，该刊获得第四届“中国高校特色科技期刊奖”。

2015年，该刊获得第五届“中国高校特色科技期刊奖”和第三届“陕西省精品科技期刊奖”。

《医学争鸣》的办刊宗旨是反映发明与创新、否定与假说、探索与发现等前沿医学思想或对已有医学成果的质疑与探讨，传播医学领域新观点、新方法和新成就，服务医学科学研究和中国卫生事业发展。

1、文题要鲜明而有特色，能确切反映全文的特定内容。中文文题不超过25个汉字，英文文题不超过10个实词。

2、署名作者应限于参加研究工作并能解答有关问题、能对文稿内容负责者，如论文学术内容的创始构思或设计者；实验数据的采集并能给予解释者；能对编辑部提出的审改意见进行核修者；能在学术界就论文内容进行答辩者。对研究工作有贡献的其他人可放入致谢栏内。左顶格写，按贡献大小统一排序，姓名之间用逗号“，”隔开。2位以上如系多单位时，则在作者的右上角分别用阿拉伯数字注明。单位在作者后，加圆括号。

3、关键词3—8个，英文名尽量用Index Medicus医学主题词表（Medical Subject Headings，MeSH）中的词，以便国际检索。中文名用《汉语主题词表》《医学主题词注释字顺表》中的译名。

4、中英文摘要应文意一致，以400字左右为宜，能独立成文。