三期工程由中国和加拿大政府合作，采用加拿大提供的加拿大坎杜堆重水堆的重水反应堆技术。秦山三期核电厂是国家“九五”重点工程，中国和加拿大两国政府迄今最大的贸易项目。它采用加拿大坎杜重水堆核电技术，装机容量2×728兆瓦，设计寿命40年，设计年容量因子85%。工程比中加主合同规定的进度提前112天全面建成投产，创造了国际33座重水堆建设周期最短的纪录。

秦山核电厂三期的业主为秦山第三核电有限公司，该公司的主要股东有中国核工业集团公司、中国电力投资集团公司、浙江省电力开发公司、申能股份有限公司、江苏省国信资产管理集团有限公司。其中：

三期1号机组装机容量70万千瓦，2002年11月并网发电。

三期2号机组装机容量70万千瓦，2003年6月并网发电。

秦山三期核电厂也称为秦山三期核电站。