石河子大学农学院（Agricultural College of Shihezi University）是石河子大学下设的二级学院，位于石河子大学北苑新区。前身是成立于1959年的新疆生产建设兵团石河子农学院，1996年6月四校合并为石河子大学时成立石河子大学农学院，现有农学系、植物保护系、农业资源与环境系、园艺系和林学系5个系和石河子大学棉花研究所、小麦研究所、石河子大学教学实验场3个教学科研机构。

1959年2月20日，正式启用农学院印章。4月1日，兵团决定将石河子农业试验场与石河子园艺队合并，划归农学院建制，改名“兵团农学院实习农场”。11月24日，中国人民解放军新疆军区生产建设兵团农学院成立。

1959年11月1日，新疆军区生产建设兵团农学院在石河子成立。石河子园艺队、新疆军区生产建设兵团机务训练班并入新疆军区生产建设兵团农学院。

1966年，由于“文化大革命“停止招生，毕业学生停止分配。

1969年，新疆军区生产建设兵团农学院撤销。

1970年9月，新疆军区生产建设兵团农学院复校。

1971年，学院从石河子搬迁到奎屯，学院为师级单位，直属兵团领导。

1976年，原新疆军区生产建设兵团农学院，改名为“奎屯农学院”，由伊犁哈萨克自治州领导。

1976年2月，“奎屯农学院”改名为“新疆维吾尔自治区石河子农学院”，为农牧渔业部直属高校。

1979年，新疆军区生产建设兵团奎屯农学院更名为石河子农学院。

1990年，国务院学位委员会批准石河子农学院为硕士学位授予单位，设立4个硕士学位点，经自治区科学技术协会批准，新疆农业工程学会，挂靠石河子农学院。

1993年，兵团经济研究所从石河子迁至学校。

1994年，兵团食品研究所成立，该所挂靠在石河子农学院。

1996年6月，四校合并为石河子大学时成立石河子大学农学院。

截至2020年11月，学院建有绿洲作物高效生产与农业环境保护科技部国际科技合作基地1个，新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室1个，特色果蔬栽培生理与种质资源创新利用新疆生产建设兵团重点实验室1个，新疆绿洲农业病虫害治理与植保资源利用自治区高校重点实验室1个，兵团林业害虫预测预报检验中心1个。新疆生产建设兵团2011协同创新中心1个。

截至2020年11月，学院以服务新疆及兵团经济建设和社会发展为宗旨，聚焦新疆及兵团优势产业开展科学研究和社会服务。近5年学院获批国家级科研项目113余项，其中国家自然基金95项，到位科研经费1.2亿余元，发表SCI论文118篇，EI论文29篇，获专利登记知识产权保护及新品种审定44项，出版学术专著50余部，获省部级以上科研奖励19项。

学院先后与美国、澳大利亚、日本等国家的许多大学和科研机构建立了长期合作关系，同时积极利用华中农业大学对口支援的契机，聘请知名专家来学校讲学和开展科研合作。教师和学生出国及到中国国内名校进修、学习和从事合作研究日趋活跃，先后举办国际、中国国内会议十余场，十余人担任中国国内学会理事、中国国内期刊编委，学院所属各学科的影响不断扩大。

截至2020年11月，农学院下设有5个系，开设有8个本科专业。

截至2020年11月，学院有教职工172人，其中，专任教师130人。专任教师中教授45人，副教授63人，讲师22人，具有副高以上职称教师占教师总数的74%；专任教师中博士学位教师105人，硕士学位教师21人，学士学位教师4人，硕士以上学历教师占专任教师数量的96.9%。教师入选国家级人才3人，享受国务院特贴专家6人，科技部创新团队带头人1人，教育部新世纪优秀人才2人，新疆维吾尔自治区教学名师1人，新疆维吾尔自治区有突出贡献中青年专家2人，兵团特聘专家1人，兵团创新团队带头人2人，兵团首批突出贡献优秀专家1人，兵团学术带头人4人，“兵团英才”第一层次3人，“兵团英才”第二层次2人，“兵团英才”第三层次5人。全院教师共建成国家级教学团队2个。

截至2020年11月，学院拥有1个博士后科研流动站，2个一级学科博士点；有4个一级学科硕士点。

博士后科研流动站（1个）：作物学

一级学科博士点（2个）：作物学、园艺学

一级学科硕士点（4个）：作物学、植物保护学、园艺学、农业资源与环境

农业部重点学科（1个）：作物栽培学与耕种学

自治区重点学科（2个）：作物学、植物保护学

兵团重点学科（1个）：园艺学

截至2020年11月，学院有国家级特色专业1个，国家级精品课程2门，国家级卓越农林人才改革项目1个；有省级精品课程6门，省级实验教学示范中心1个；有校级教学团队2个，校级特色专业2个，校级人才培养创新试验区1个，校级精品及一类、二类课程20门。

国家级特色专业：农学

省级实验教学示范中心：食品科学与工程教学实验中心

国家精品课程：土壤肥料学

国家线下一流本科课程：作物育种学

自治区精品课程：园艺植物育种学等

兵团精品课程：耕作学

文化活动

据2022年4月学院官网显示，学院开展民族团结一家亲、茶文化知识竞赛暨茶艺展示等活动。

2024年1月，被命名为第十一批全国民族团结进步示范区示范单位。