根据
和名类聚抄，在承平年间（
931年至
938年）时，直入郡下辖有朽网乡、三宅乡、直入乡、柏原乡。
1889年04月01日：实施町村制，直入郡下辖竹田町、丰冈村、明治村、冈本村、玉来村、松本村、入田村、宫砥村、妪岳村、菅生村、城原村、宫城村、荻村、柏原村、白丹村、久住村、都野村、长汤村、下竹田村、阿苏野村。（1町19村）
1950年01月01日：阿苏野村改隶属大分郡。（4町12村）
竹田町、玉来町、丰冈村、松本村、入田村、宫砥村、妪岳村、菅生村、城原村、宫城村合并为
竹田市。[1]
1955年03月20日：久住町和都野村合并为久住都町。（2町3村）
2005年04月01日：竹田市、荻町、久住町、直入町合并为新设置的竹田市，同时直入郡因无管辖町村而废除。