玛纳斯湖湿地是准噶尔盆地西部的一个大型咸水湖及周围盐沼和草甸。

准噶尔盆地西部的一个大型咸水湖及周围盐沼和草甸。近30年来因农业垦荒截水，发源于哈比尔原山的玛纳斯河完全断流，湖区已变成干涸的盐地和盐漠。地下水位较高，离地面约2米。东面和南面是固定、半固定沙漠（古尔班通道古特沙漠）。

气候状况：温带干旱气候，年平均气温6℃，年降水量100～150毫米。

主要植被：温带干旱气候。大多数地带被荒漠植物梭梭群落占据。

保护措施：在其西南面有一面积为54,670公顷的梭梭自然保护区，由新疆林业厅主管。

土地利用：盐硝开采；围垦农作。

干扰和威胁：农业垦荒造成湖区盐渍化、沙漠化，湿地已名存实亡。

经济和社会价值：盐及地下水资源丰富。

湿地鸟类：新疆大学曾在该地采集到水涉禽标本19种包括黑鹳和灰鹤，但据马鸣等人1986年5月下旬在大盐池泥沼附近调查仅记录到柳莺、白喉林莺、漠 、毛脚沙鸡、啄木鸟、草原雕等。据说水邻迁飞路过此地已不停留。 玛纳斯湿地以水库、鱼塘、沼泽、芦苇滩等水系为主，湿地水域辽阔，池塘众多，滩涂宽阔，植物丛生，形成了芦苇群落、荷花群落等典型的湿地植被景观。湿地位于世界候鸟迁徙路线3号线路中，内有国家一、二级珍稀鸟类保护动物15余种，其中国家一级保护动物7种，有短尾信天翁、黑鹳、中华秋沙鸭、白肩雕等。每年在此越冬的大天鹅有100多只，灰鹤、蓑羽鹤有500余只。

玛纳斯湖湿地形成8年来，水面一直都保持在一百平方公里，目前，玛纳斯湖湿地已被列入国家重要湿地名录。这是新疆生产建设兵团石河子垦区实施节水农业创造的一个奇迹。上个世纪50年代，玛纳斯湖面积为550平方公里，到了60年代，由于无节制的农业垦荒和截水灌溉，注入该湖的河道从此断流。上个世纪90年代末，新疆生产建设兵团石河子垦区引进滴灌技术，建成了中国最大的膜下滴灌基地，1999年以来，石河子垦区将每年滴灌节约的2亿立方米水全部输向玛纳斯河流域下游，使玛纳斯湖重现生机。目前，玛纳斯湖湿地面积已超过100平方公里。