1945年11月，王嘉猷在南京由中共苏南区党委特派员
方休在上海交大时，王嘉猷先后任交大地下党支部书记、上层党组书记，参与领导历次上海学运。在上海“反甄审”斗争中，组织刚从南京转到上海的南京中大同学在铁甲车冲向请愿队伍时涌向前列，与铁甲车对峙一夜，并带头挤到
蒋介石住处请愿。参与领导了上海“反饥饿、反迫害、反内战”游行，负责协调各校的宣传品排列，以自己创作的巨幅立体标语，“我们要吃饭（附有5个纸制破饭碗）”为前导，“一天的菜金还不够买三根油条（下面挂三根油条）”压后阵，主题突出、形象显明，引起强烈反响。通过自1943年开始的“清毒运动”等各次运动，培养了不少党的积极分子，发展了一批党员，其中有的成为大学联、交大学生会、宣传委员会和社团联的领导。1946年介绍由南京中大一同转入交大的江泽民入党，并单线领导，直至解放。
1947年上海交大毕业后，脱产任专职大学区委委员兼指导学运的党内刊物《号角报》主编，同时负责领导上海医学院、上海商学院等地下党支部。先后组织上海交大等校已暴露的党员和积极分子向解放区转移，并负责向解放区输送医务人员和医药、器材的组织工作。
1948年，由南京市委调他回南京组织家庭党支部，并任支部书记，利用在国民党机关工作的地下党员工作之便，主持秘密调查、编绘国民党机关组织系统和详细分布的地图、系统表，为共产党接管南京市提供了详细的单位所在地及人员分布情况，对接管工作的顺利开展作出了贡献，受到军管会领导的表扬。
1949年南京解放后，任南京水厂军代表，1951年改任南京机床厂军代表兼书记，带领全厂试制成功我国首台全齿和自动车床。1952年以后任南京电影机械厂厂长，组织领导试制成功各种电影技术设备，保证了大规模发展的影院、放映队和电影制片厂等对电影设备不断增长的需求。1964年调北京筹建中国电影科学技术研究所，任所长，主持全国电影技术的开发和推广工作。领导试制成功一批国产电影技术设备：国产首套特大型银幕、全立体声电影音响；国产首套大型环幕、球幕等，荣获国家科技二等奖和部级科技一等奖。