玉林市交通运输局是市政府主管全市公路、水路交通运输行业的政府工作部门。

（一）贯彻执行国家和自治区有关交通运输的方针政策和法律法规。组织起草有关交通运输工作的规范性文件草案。

（二）拟订全市公路、水路交通运输行业发展规划、中长期计划并监督实施；负责全市交通运输行业统计和信息引导。

（三）负责全市交通运输基础设施建设项目和管理并监督实施；负责航道疏浚、港口及港航设施建设使用岸线布局的行业管理。

（四）负责全市县乡公路和全市水路基础设施的维护；负责全市县乡公路路政、航道行政和道路运政管理；负责交通运输通讯、导航的行业管理。

（五）协同有关部门规划、管理公路沿线开发区的建设设施，规范管理交通基础设施建设市场。

（六）负责全市道路、水路运输的行业管理，培育和管理交通运输市场，引导交通行业优化结构、协调发展。

（七）指导交通行业交通运输体制改革；维护道路、水路交通行业的平等竞争秩序。

（八）负责道路运输（含出租汽车运输、汽车租赁业和城市公交车行业）、营业性客货运输站（场）、汽车维修市场、机动车辆检测站、汽车驾驶学校和机动车驾驶培训的行业管理；组织、协调重点物资和紧急客货运输。

（九）负责拟订全市交通运输行业科技发展规划，指导和监督实施交通行业技术标准和规范工作，组织重大科技开发，推动行业技术进步。

（十）负责收费公路的行业管理工作；受业主的委托、负责324国道玉林市境内段通行费收费管理工作。

（十一）指导本市交通运输系统的精神文明、职工队伍建设。

（十二）负责行业的涉外工作，指导行业利用外资工作；管理公路、水路交通利用国际金融组织贷款项目；开展对外合作与交流。

（十三）负责全市公路、道路运输、港口航道行政执法（含治理公路超限）工作。

（十四）承办市人民政府和自治区交通运输厅交办的其他事项。

根据上述职责，玉林市交通运输局设8个内设机构。

（一）秘书科

负责组织协调局机关及下属各单位工作；负责文电、会务、机要、档案、政工人事等工作；承担信息、安全、保密、政务公开等工作。

（二）综合科

负责交通运输行业安全生产、考核评比、行业协调、精神文明建设、信息引导、合作交流等工作。

（三）计划财务科

负责全市交通行业财务会计工作的指导、协调、监督；负责局机关及直属单位财务、交通建设资金的筹集、管理、国有资产的监管、年度项目财务计划、行业利用外资等工作。

（四）政策法规科

负责起草有关交通运输的规范性文件草案；负责对全市交通运输行业行政执法情况进行监督、检查；负责交通运输行政复议、行政赔偿、治理“三乱”的牵头工作、法制宣传、执法培训、纠风、协调和处理信访、行业稳定等工作；负责与行政审批事项相关的督查、投诉和举报工作。

（五）审计科

负责全市交通运输系统内部审计工作；接受上级审计机关的业务指导和监督，并报告工作，拟订审计规划、规章制度、计划、方案。

（六）规划科（总工程师办公室）

负责拟订全市交通基础设施的建设计划和发展规划；负责指导、协调全市公路建设和管理养护工作；负责公路、码头、农村场站等交通基础设施建设项目的立项、审查、预算、工程可行性报告及前期其它工作的初审和报批等工作；负责指导、协调工程技术和工程质量工作；负责研究和编制全市交通重点建设项目计划，分析汇总全市交通重点建设项目的进展情况，跟踪检查重点建设项目计划执行情况；负责协调重点交通建设项目上在建设过程中资金平衡、招标投标等工作。

（七）公交科（出租车管理办公室）

负责起草玉林市城市公共客运交通行业的发展方案及行业法规、规章；负责编制全市城市公共客运交通行业规划、行业管理、客运交通监督、公交线路审批和投标管理等工作；负责全市出租车行业的管理工作。

（八）行政审批办公室

负责受理审批、审核市交通运输的行政许可和非行政许可项目；组织协调现场勘察；检查、指导、监督道路和水路运输的各项许可审批业务；执行行政审批政策，研究制定行政审批业务流程，规范行政审批实施程序；负责窗口的日常管理工作，在遵循市政府政务服务中心有关规定的基础上，按规范化、标准化、制度化要求建立健全窗口规章制度；负责与行政审批事项相关的咨询、协调工作。

市交通战略办公室

市交通战备办公室为市国防动员委员会的常设办事机构。负责拟订市国防交通保障计划与规划；负责本地区性的国防运力动员和运力征用；按照国家有关规定，制定和实施本地区的国防交通物资储备计划，调用国防交通物资；组织本地区的国防交通科学技术研究及其成果的推广、应用；指导、检查、监督本地区国防交通工作，协调处理有关问题等工作。

监察室按有关规定设置

2021年6月，玉林市交通运输局机关党委荣获“广西壮族自治区先进基层党组织”称号。