物种命名：物种是生物分类学的基本单位。物种是互交繁殖的相同生物形成的自然群体，与其他相似群体在生殖上相互隔离，并在自然界占据一定的生态位。地球上的物种以百万计，千变万化，各不相同，分类系统是生物种类的查找系统，可借以认识和查取有关资料。分类系统是阶元系统，通常包括7个主要级别：界、门、纲、目、科、属、种。种（物种）是基本单元，生物学名二命名法（binomial nomenclature），亦称“双名法。”即属名加种名。属名在前，种名在后。属名是名词，第一个字需大写；种名是形容词，是限制属名的，故小写。

物种即种（Species）。不同专业的生物学家对物种的概念有不同的理解。

●分类学是依据表型特征识别和区分生物的基本单位。

●现代遗传学则把物种定义为：物种是一个具有共同基因库、与其他类群有生殖隔离的群体。

●生态学家则认为，物种是生态系统中的功能单位，不同物种占有不同的生态位。如果两个物种以相似的方式利用同一有限的资源和能源，它们必定会发生竞争和相互排斥，其中必定有一个获得相对的胜利；如果一个物种的种内发生变异，占据了多个生态位，那么从生态学的角度看，就意味着新种的生成。

●陈世骧认为：种是由种群所组成的生殖单元，在自然界占有一定的生境，在系谱上代表一定的分支。这个定义包括种的四个标准：种群组成、生殖隔离、生境地位和系谱分支，是一个广泛接受的较为完善的定义。

对物种问题争论的焦点归纳起来主要有两点：一是把种定义为形态结构相似的个体群，把物种分为形态学种和分类学种；二是强调种间生殖隔离的机制。

物种乃是生物学的根本，认识物种是探索生物学的第一步。只有在物种描述后，对于种群、遗传和生物化学多样性的研究才有可能开展。一份标准的物种名录，对于生物学和生态系统的研究、以及自然资源管理的质量保障十分关键。此外，发现物种也能够帮助命名者及年代们了解有多少物种、那些物种将会灭绝。

研究生物分类的方法和原理的生物学分支。分类就是遵循分类学原理和方法，对生物的各种类群进行命名和等级划分。分类学曾被称为系统分类学，但它与系统学很易混淆，系统学是研究生物的分异度（多样性）以及它们中间的任何一个类群和其他所有类群的各种关系的科学，曾称为分类系统学。三者的共同目的是从理论上和实践上，阐明种类之间的关系（或亲缘关系），建立自然系统，确定各类群的命名和排序，总结其进化历史。

地球上现生的物种以百万计，千变万化，各不相同，如果不予分类，不立系统，便无从认识，难以利用。分类系统是生物种类的查找系统，可借以认识和查取有关资料。分类的对象是形形色色的种类，都是进化的产物；分类学在于阐明种类之间的历史渊源，使建立的分类系统反映进化历史。因而从理论意义上说，分类学是生物进化的历史总结。

分类学是综合性学科。生物学的各个分支，从古老的形态学到现代分子生物学的新成就，都可吸取为分类依据。分类学亦有其自己的分支学科，如以染色体为依据的细胞分类学（或染色体分类学），以血清反应为依据的血清分类学，以化学成分为依据的化学分类学，等等。动物、植物和细菌，作为三门分类学，各有其特点；病毒分类则尚未正式采用双名制和阶元系统。

人类在很早以前就能识别物类，给以名称。汉初的《尔雅》把动物分为虫、鱼、鸟、兽4类：虫包括大部分无脊椎动物；鱼包括鱼类、两栖类、爬行类等低级脊椎动物及鲸和虾、蟹、贝类等；鸟是鸟类；兽是哺乳动物。这是中国古代最早的动物分类，四类名称的产生时期看来不晚于西周。这个分类，和林奈（1758）的六纲系统比较，只少了两个纲（两栖纲和蠕虫纲）。

古希腊哲学家亚里士多德采取性状对比的方法区分物类，如把热血动物归为一类，以与冷血动物相区别。他把动物按构造的完善程度依次排列，给人以自然阶梯的概念。

17世纪末叶，英国植物学者J．雷曾把当时所知的植物种类，作了属和种的描述，所著《植物研究的新方法》（1682）是C．林奈以前的一本最全面的植物分类总结。J．雷还提出“杂交不育”作为区分物种的标准。

近代分类学诞生于18世纪，它的奠基人是瑞典植物学者林奈。林奈为分类学解决了两个关键问题：

①建立了双名制，每一物种都给以一个学名，由两个拉丁化名词所组成，第一个代表属名，第二个代表种名。例如 Panthera tigris是虎的学名，Bombyx mori是蚕的学名。

②确立了阶元系统。林奈把自然界分为植物、动物和矿物三界，在动植物界下，又设有纲、目、属、种四个级别，从而确立了分类的阶元系统。每一物种都隶属于一定的分类系统，占有一定的分类地位，可以按阶元查对检索。并首先在1753年印行的《植物种志》和1758年第10版《自然系统》中应用于植物和动物。这两部经典著作，标志着近代分类学的诞生。

林奈相信物种不变，他的《自然系统》没有亲缘概念，其中6个动物纲是按哺乳类、鸟类、两栖类、鱼类、昆虫、蠕虫的顺序排列的。J．－B．de拉马克把这个颠倒了的系统拨正过来，从低级到高级列成进化系统。他还把动物区分为脊椎动物和无脊椎动物两类，并沿用至今。但是，由于他的进化观点在当时没有得到公认，因而对分类学影响不大。直到1859年，C．R．达尔文的《物种起源》出版以后，进化思想才在分类学中得到贯彻，明确了分类研究在于探索生物之间的亲缘关系，使分类系统成为生物系谱——系统分类学由此诞生。

分类阶元、命名模本方法和鉴定分类系统是阶元系统，通常包括7个主要级别：种、属、科、目、纲、门、界。种（物种）是基本单元，近缘的种归合为属，近缘的属归合为科，科隶于目，目隶于纲，纲隶于门，门隶于界。随着研究的进展，分类层次不断增加，单元上下可以附加次生单元，如总纲（超纲）、亚纲、次纲、总目（超目）、亚目、次目、总科（超科）、亚科等等。此外，还可增设新的单元，如股、群、族、组等等，其中最常设的是族，介于亚科和属之间。林奈晚年承认种内有变种。通常种下分类，动物只设亚种单元；植物设亚种、变种、变型等单元；细菌设品系、菌株等单元。

列入阶元系统中的各级单元都有一个科学名称。命名的单元不再是抽象的单元，而是含有实际种类的物类单元。分类工作的基本程序就是把研究对象归入一定的系统和级别，成为物类单元。所以分类和命名是分不开的。

瑞典植物学家林奈在他的《自然系统》（Systema Naturae,1786年）中制定了生物学名二命名法（binomial nomenclature），即属名加种名。属名在前，种名在后。属名是名词，第一个字需大写；种名是形容词，是限制属名的，故小写。在种名之后还应加上定名者的姓氏或其缩写。例如狼的学名应是Canis lupus Linne；人的学名：Homo sapiens,L。生物学名是用拉丁文写的，因为拉丁文是当时欧洲文化界流行的书面文字，文字较固定，变化较小。对于亚种一般采用三名法（trinomial nomenclature），即在种名之后再加上一个亚种名，如尖音库蚊淡色亚种（淡色库蚊）为Culex pipieus pallens Coquillet（1898）。

种和属的学名后常附命名人姓氏，以标明来源，便于查找文献。蚕蛾属学名后的L．，是命名人林奈Linnaeus的缩写，马尾松学名后的Lamb．，是命名人兰伯特Lambert的缩写，通常除林奈等少数之外，一般命名者姓名引用时不应缩写。亚种命名采取3名制，即在属名、种名后再加亚种名。例如华南虎和东北虎都是虎的亚种，前者的学名是Panthera tigris amoyensis Hilz-heimer，后者是Panthera tigris altaica Temminck。变种学名亦来取3名制，只是在种名与变种之间加上拉丁文变种varietas的缩写var．，例如中华按蚊原先鉴定为赫坎按蚊的变种（现已分出为独立的种）学名曾是Anopheleshyrcanes var．sinensis Wedemann。

以名人之名命名新物种成为趋势：一种猿与英国喜剧演员约翰·克利斯“同名”；一种马蝇名为碧昂斯，因为它的尾部与那位流行歌手的臀部有相似之处；美国演员哈里森·福特的姓名用在一种蜘蛛身上；原苏联领导人米哈伊尔·戈尔巴乔夫“变身”为在玻利维亚一种兰花。

德国研究蜘蛛的学者彼得·耶格用名人姓名命名若干种蜘蛛。他说，新发现物种通常只能引起少数专业人士关注，假如给物种起个响亮的名称，能让更多人知道它，保护它。

物种命名无需征得当事人同意，而普通人同样可以让自己的名字与某个物种挂钩，但要支付2600欧元（约合3400美元）。提供这项服务的德国非营利机构Biopat把收入用于促进生物多样性项目。