这是《战锤40000：战争黎明(Warhammer 40000: Dawn of War)》的最后一部资料片，由Relic Entertainment和Iron Lore合作开发。《战锤40000：灵魂风暴》所讲述的故事发生在由众多行星围绕着的一团奇异风暴中。这片神秘的空间引诱着众多种族前来探险；但强大的星际风暴摧毁了这些探险队的导航系统，并迫使他们降落在周围的行星――力量强大的混乱力量所盘踞的星球――表面。

新作中除了包含前作中出场的七方势力，更新增了“战争修女(Sisters of Battle)”和“暗黑神族(Dark Elder)”两大派系。他们不但拥有独特的战斗单位、建筑物和科技，更需要借助不同寻常的资源已发动更强大的攻击。 　作为在《战锤40000：暗黑圣战(Warhammer 40000: Dawn of War- Dark Crusade)》广受好评的“世界征服”模式，将在本作中获得大幅改进。不过，玩家此次将面对由四颗行星和三颗卫星组成的“星系征服”模式的考验。 　此外，为了激励玩家进行更多地在线游戏，开发商还师法微软“Games for Windows-Live/跨平台游戏”服务中的“奖励(Achievenment)”设置，为《战锤40000：灵魂风暴》开发了在线奖励内容。而且，不同的派系将获得大相径庭的在线奖励。 　与此前多款部作品一样，在Relic和Iron lore合作开发的“灵魂风暴”中，玩家不必拥有前作即可进行游戏，并可在多人部分使用最新加入的两个全新种族。

故事发生在帝国的第41个纪元的某一年，异次元风暴袭击属于帝国管辖范围内的考拉瓦星系，作为星系的主导势力，考拉瓦帝国防卫军守护者军团的统治地位受到了前所未有的挑战。在次元风暴的袭击下，伴随着来自死亡之眼中的混沌军团——在何露斯叛乱是倒向混沌的阿尔法军团开始了对考拉瓦的侵袭，数百万考拉瓦守护者军团的士兵在混沌的侵袭下丧生。与此同时，似乎是受到风暴的影响，长眠考拉瓦三号星球在太空亡灵逐渐从他们的坟墓世界清醒，开始了对考拉瓦星系的毁灭！而为了阻止太空亡灵，方舟世界乌瑟维的灵族战士也在先知卡里丝的带领下出现在了考拉瓦——数万年前考拉瓦曾经是灵族繁衍升息的领土。为了博取邪神色孽欢心和无止尽的劫掠，黑暗灵族在执政官黑心卡伯的领导下也在神秘而古老的魅道关口中出现了，开始了他们在考拉瓦的“欢乐”。不知道为了什么原因，亦或者是苏勒连长所率领的血鸦战团在克诺努斯星球上的发现所指引，在英德力克.波利奥连长的带领下，血鸦战团也来到了考拉瓦……等待他们的将是无休止的战斗。作为钛帝国的重要军事力量，弗夏家族为了上善善道也来到了考拉瓦，夺取了考拉瓦，钛帝国在银河乃至宇宙中的势力也将继续扩大。兽族军阀戈古兹不甘心在克诺努斯上的失败，也来到了考拉瓦，带领着生活在考拉瓦2号星球的那些从来就没有被帝国防卫军政府过的欧克兽人们开始了新的战斗。由于风暴的侵袭，帝国防卫军252军团倍受帝国方面的质疑，而帝国防卫军方面则任命了更加有经验的帝国将军来领导在考拉瓦已经岌岌可危的帝国防卫军252守护者军团，为了重申帝国守卫军在考拉瓦的地位，他们必须奋而抗争。然而考拉瓦在异端审判庭旗下的战斗修女神圣玫瑰团的眼里，这里没有一片土地是干净的，考拉瓦必须被净化……9大势力在考拉瓦开始了一场最混乱而最激烈的战争…