澎湖厅是
台湾清治、日据时期的行政区划之一，辖域为今
澎湖县。
雍正五年（1727年）应
闽浙总督高其倬之请，原附属于台湾县之澎湖设立澎湖厅，隶属福建省
台湾府管辖，光绪十三年（1887），台湾建省，于台湾中部新设台湾府（中路），原台湾府（南路）改称
台南府，澎湖厅仍属之。
1895年日据后，
台湾总督府改清领时期之府为县，府辖之县（厅）为支厅，但澎湖厅仍维持建制直属总督府管辖，直至大正九年（1920）与阿猴厅（今屏东县及旗山地区）及
台南厅一部分（今高雄市及冈山凤山地区）合并为
高雄州设立澎湖郡，大正十五年（1926）再独立复设置澎湖厅，
1945年二战结束前共管辖二支厅。