1949年10月，四十七军挺进湘西，湘西军区随后成立，由四十七军兼，机关设在沅陵。四十七军军长曹里怀兼湘西军区司令员、军政委周赤萍兼湘西军区政委。下辖沅陵军分区、会同军分区、永顺军分区。

1949年10月底至12月8日，人民解放军发动了“川东战役”，47军139师、141师奉命入川作战，于11月30日解放重庆，随队部队奉命东返，回师湘西，与留守部队140师开始了艰苦卓绝的湘西剿匪斗争。为全面完成湘西剿匪建政任务，狠狠打击顽匪气焰，1949年9月中旬，中南军区命令第47军经营湘西。随后，四野给第47军下达命令：进驻湘西，经营湘西，争取在不长时间内彻底肃清匪患。

第47军奉命挺进湘西，并湘西军区，军部设沅陵，第47军军长曹里怀兼湘西军区司令员、政委周赤萍兼湘西军区政委。

所属139师并沅陵军分区，负责辰溪、沅陵、溆浦、麻阳、凤凰、乾城、永绥、沪溪八县的剿匪工作，师部设辰溪；

第140师并会同军分区，负责芷江、晃县、会同、靖县、通道、黔阳、怀化、绥宁8县的剿匪工作，驻芷江；

第141师并永顺军分区，负责桑植、大庸、龙山、保靖、古丈、永顺6县的剿匪工作，师部设永顺。

1950年1月27日，湘西军区、四十七军司令部、政治部向剿匪部队发布《剿匪战役政治动员令》。1月下旬，湘西军区进剿芷江、怀化地区杨永清、彭玉清股匪，歼敌850余名，俘掳负责组织怀(化)黔(阳)边界土匪武装的国民党湖南省党部委员何冬明、杨景民。2月3日，湘西军区、四十七军联合发布《告土匪书》，向土匪严正阐明我剿匪决心及有关政策。对瓦解全区匪众和孤立顽固的匪首起了积极的作用。

1950年4月2日，中国人民解放军四十七军一四〇师四一八团、四二〇团三百余名指战员在宗庚哲团长的带领下快速奔袭，直插会同县沙溪乡八宝山，打响八宝山剿匪战斗，最后活捉匪首陈通焕，取得了会同剿匪的重大胜利。

1950年4月15日，四十七军、湘西军区根据中南军区和湖南军区关于“收缩兵力，重点进剿”的指示精神，联合发布《剿匪命令》，四十七军集中全部兵力和地方武装，在东西200华里、南北400华里的中心区铺开梳篦式的搜剿和驻剿。

1950年10月1日至7日，湘西军区在沅陵召开全区英模代表大会，表彰在剿匪中作出突出贡献的先进单位43个，剿匪模范功臣3390名。10月22日至25日，湘西军区在芷江召开巩固中心区代表会。讨论、研究彻底清除潜伏匪特与严防恶霸破坏等问题。12月31日，湘西边缘区会剿战役结束，共歼匪8000余人。同日，湘西军区发布公报：湘西股匪基本肃清，共歼匪73000余人。

1951年3月26日至27日，湖南省人民政府等六大单位召开湘西剿匪胜利功臣代表大会。从1949年10月至1951年2月，湘西歼灭匪特11万余人，根除了百年祸患。大会表彰湘西军区范华英雄班、钢铁第八连、英雄侦察排3个先进单位和丛士林、纪士信、赵启英3个先进个人。