经教育部批准，清华大学艺术与科学研究中心于2001年5月24日正式成立。

艺术与科学中心的宗旨是面对21世纪的需求，为清华大学艺术与科学的跨学科基础理论研究及应用研究搭建平台，致力于高水平的学术研究基地和学术交流中心的建设，同时为复合型人才的培养做出试验性探索。

中心由李政道教授和吴冠中教授任名誉主任、清华大学美术学院书记李当岐教授任中心主任、鲁晓波教授任常务副主任。现有专职研究人员15名，校内外兼职人员10名，分属3个不同的研究方向，分别为：基础理论研究、应用研究及教育研究。并于2002年4月成立了中心顾问委员会，顾问委员会分别由不同领域卓有成就的专家、学者担任，负责该中心发展的宏观指导。

为保证学术研究的健康发展，该中心科研管理将通过课题组研究人员聘任制和激励机制的建立，形成学术争鸣、人员流动、内外联合的运作模式，不断探索创新，使之成为艺术与科学跨学科研究的“思想库”、“信息库”和“人才库”，努力将中心建设成为有影响力的高水平研究机构。