清华大学科学博物馆是清华大学筹建的项目，希望科学博物馆再现清华理工科学科群在中国近代科技史上的成就，促进科学传播、激励科技创新，进一步推动人文与理工的交叉融合，与清华大学艺术博物馆并列成为清华园科学与艺术的两个殿堂。

按照学校“十三五”事业发展规划，清华大学科学博物馆将在2021年建校110周年之际建成开放。清华科学史系将继承清华学人在科技史领域的开拓精神，促进理工科与人文社会科学的有机衔接。科学史系将参与主持科学博物馆建设，并以此为依托，打造多层次多方位的文理交叉平台。

清华大学科学博物馆的永久馆所地址是艺术博物馆和美术学院之间的空地，由清华大学艺术博物馆的设计者，意大利著名设计家博塔来设计。未来，清华科博和清华艺博比邻而居，将便利观众参观，成为清华园内科学与艺术并列的殿堂。

一百多年来中国人民学习西方科学技术的历程没有博物馆做见证。清华科学博物馆的建立，就是想在这个意义上弥补一点历史的欠缺。

清华大学科学博物馆馆长吴国盛。

正在筹建中的清华大学科学博物馆，是中国第一家综合类收藏型科学博物馆。它将以科技文物和高科技互动展品相结合的展陈方式，再现人类科技史上伟大的科学发现和技术发明，再现清华理工科在中国近现代科技史上的辉煌成就，成为促进科学传播、激励科技创新的清华新景观。

清华大学科学博物馆将组建三大常设展厅：科学源流（展示西方科学技术的发展历程）、天工开物（展示中国古代的技术和发明）、行健不息（展示清华理工学科的发展历史）。临时展厅将征集国内外珍贵科技文物进行主题布展。

永久馆址位于校园东部艺术博物馆与美术学院大楼之间空地，初步计划建筑面积1万5千平米，展厅面积约7千平米。在永久馆所建成之前，科学博物馆在清华大学蒙民伟人文楼B2层设置临时展厅。

意大利著名设计家博塔来

2018年4月24日，清华大学第14届党委第31次常委会决定成立清华大学科学博物馆（筹）。同日，吴国盛教授被任命为清华大学科学博物馆（筹）馆长。

2019年4月24-5月3日，“百年器象——清华大学科学博物馆筹备展”在清华大学美术学院A座一楼多功能厅开展。

2019年12月，“百年器象——清华大学科学仪器历史展”在蒙民伟人文楼B2层重新布展。

2020年9月，“神机妙算——计算器具历史展”在蒙民伟人文楼B204-205开展。

2020年12月17日，由北京博物馆学会与清华大学科学博物馆联合主办的“神机妙算--计算器具历史展”与科学博物馆建设研讨会在清华科博临时展出地点——清华大学人文楼举办。

2024年11月，清华大学科学博物馆建筑设计样式中的水运仪象台镇馆之宝已确定：该校正在自主研制、全尺寸复原的水运仪象台，建成后将作为核心展品置于常展厅的显要位置，恒常运行，长期展出。该校介绍，水运仪象台是北宋时期发明的兼有计时、报时、天象演示和天象观测功能的超大型科学仪器，标志着中国古代天文仪器制造史上的高峰，被誉为是世界上最早的天文钟，实物已消失。