电视动画《深夜的超自然公务员》改编自たもつ叶子创作的同名漫画，于2018年6月宣布了动画化的消息。动画由LIDENFILMS负责制作，于2019年4月7日至6月23日每周日在TOKYO MX、SUN电视台、BS11首播，中国大陆由bilibili独家正版发布，全15话（12话正篇+1话OAD+2话OVA）。

任职于新宿区政府的宫古新，本应成为一个普通的公务员，却被调遣到了一个东京23区各区都无人知晓的“夜间地区交流科”工作。

工作的内容是，解决各种妖怪们引起的超自然事件。

与部门的前辈即课长榊京一，和狂热爱好超自然现象的姬冢圣央一起，每日与超越人类常识的存在相处，日日夜夜出勤工作。

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OP《dis-communicate》

ED《约束のOverture》

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网络广播节目《<深夜的超自然公务员>“夜间地域交流科” 广播通讯》（「真夜中のオカルト公务员」夜间地域交流课　ラジオ通信）于2019年4月5日至7月22日在音泉发布，隔周周一更新一回，全8回。主持人由为宫古新配音的福山润和为韦韦科约特尔配音的土岐隼一担任。