淮河入海水道二期工程于2022年7月30日开工建设。主要建设内容为在一期工程基础上，按设计行洪流量7000立方米/秒标准，扩挖全线深槽，加高加固两岸堤防，扩建工程沿线5座枢纽建筑物。淮河入海水道二期工程还包括沿线大大小小的水利工程的建设，是个系统工程。

淮河入海水道二期工程是淮河流域防洪工程体系的标志性、战略性工程，我市境内总投资309.3亿元，涉及阜宁、滨海、射阳三县和省淮海农场，全长96公里。目前，已开工建设河道工程28.3公里，其中，先行段14.5公里河道工程于2022年开工建设，已基本完成主体工程施工，累计完成土方作业2610万立方米，堤坡、泓坡混凝土预制块防护70万平方米。

2022年7月30日，淮河入海水道二期工程开工建设。

2023年5月29日，江苏省发展改革委批复淮河入海水道二期工程初步设计报告，标志着该工程前期工作全面完成，正式进入全面实施阶段。

2024年1月27日，淮河入海水道二期工程阜宁县境内工程现场推进会召开阜宁境内13.8公里总投资约20.8亿元年度河道工程开工建设。

2024年2月1日，淮河入海水道二期工程盐城段先导项目张家河闸站工程顺利通过机组启动及合同完工验收，标志着该工程已全面具备防洪排涝的能力和条件。11月29日，淮河入海水道二期工程在淮河入海水道淮安枢纽处顺利截流。

从洪泽湖往东流向黄海的水道就是淮河入海水道，全长160多公里。淮河入海水道二期工程是把原有的这条入海水道拓宽、深挖，相当于把车道拓宽，把两车道变六车道。

张家河闸站在江苏盐城滨海淮河入海水道的下游。是淮河入海水道二期工程的先导工程之一，于2022年7月30日开工建设。

淮安水利枢纽大运河立交工程，是淮河入海水道二期工程的关键节点工程，同时它也是162.3公里水道上五座需要改建的大型枢纽工程之一。京杭大运河和淮河入海水道在此立体交会。

对于淮河水系来说，二期工程建成后，其航运功能将会得到进一步的发挥。水道拓宽之后，2000吨级的船舶就可以从淮河进入通榆河，然后进入苏北的入海河道，从而进入大海。这一改变带来的经济效益值得期待。