淮安市档案馆收藏了反映淮安历史真实面貌的旧政权档案、革命历史档案、建国后党政机关文书档案和一部分科技档案、专门档案、声像档案以及各种报刊、杂志、图书等资料，起止年限为1865年～2011年。

淮安市档案馆收藏了起止年限为1865年至2011年的旧政权档案、革命历史档案、建国后党政机关文书档案，以及一部分科技档案、专门档案、声像档案，以及各种报刊、杂志、图书等资料。馆藏档案272个全宗86725卷，资料23481册，照片3779张，上架排列总长度为1155米。

旧政权时期档案包括清代档案和民国档案。清代档案有同治、光绪年间房地契及雍乾时期谕旨、朱批奏折仿真件等。民国档案有淮阴党政军和地方武装、中统、三青团等组织的文书材料；有江苏省高等法院淮阴第二分院文书和诉讼卷宗；有各种行业公会（工会）会员登记表，淮海省立淮阴师范、淮阴私立渔沟中学等7所学校教职员、学生名册，江苏银行清江分行会计资料等。

革命历史档案包括第二次国内革命战争时期淮盐特委、长淮特委，抗日、解放战争时期中共淮海地委、中共华中六地委、六专署、苏皖边区政府及其所属各县委、县政府形成的一部分材料，涉及对敌斗争、土改运动、参军支前、生产自救、组织宣传等方面内容。

中华人民共和国成立后档案有淮阴地区、清江市、淮安（淮阴）市党政机关、人民团体和部分企事业单位及撤销单位的档案，门类包括文书、会计、涉外婚姻、纪检案件、死亡干部档案等；有刘少奇、胡耀邦、朱镕基、乔石、温家宝、李岚清等党和国家领导人视察淮安，华罗庚、于光远、周太和等科学家来淮考察的照片和录像带；有邓小平、李鹏、李一氓、张爱萍、赵朴初、荣高棠等人给淮阴有关单位的题词等。另外，本馆还收有集体组织和个人委托代保管的档案，如著名京剧表演艺术家、荀派传人宋长荣音像档案资料等。