浙江省生物技术制药工程重点实验室承担国家新药创制重大科技专项4项、863计划项目3项、973计划项目子课题1项，教育部“长江学者”创新团队、浙江省重点科技创新团队各一项，国家自然基金126项（年均立项20项左右），其中国家优秀青年基金1项，国家自然基金重大项目（培育）2项，浙江省自然基金杰青团队等省部级课题近百项，在研总经费超过1亿元。

重点聚焦成纤维细胞生长因子（FGFs）为代表的基因工程和蛋白质药物，开展生长因子与疾病的研究，形成了化学生物学、创伤修复与组织再生、蛋白质结构、药物靶向递送系统、糖尿病并发症、代谢组学、蛋白质组学、内分泌与代谢性疾病研究、生物反应器与药物开发及基因重组药物工程技术开发等研究方向，为疾病靶点发现、新药开发奠定了基础。

浙江省生物技术制药工程重点实验室于2007年成立，依托温州医科大学药学院，现有实验室面积4500余平方米，其中中试车间面积2000余平方米。

浙江省生物技术制药工程重点实验室研究仪器设备完善，拥有流式细胞仪、激光共聚焦显微镜、蛋白质四级杆质谱、分子-分子相互作用仪、液相色谱-质谱、600MHz核磁共振谱等先进科学仪器近百台，总价值达8000余万元。

奖励奖项：实验室共获得国家和省部级奖励近10项，其中包括国家科技进步一等奖（2015年）、国家技术发明二等奖（2009年）、教育部高等学校科学研究优秀成果奖（自然科学类）一等奖（2016年）、浙江省科学技术一等奖（2012年）、中华医学科技一等奖（2008年）等。

论文及专利：实验室近五年发表SCI论文近500篇，以第一和通讯作者署名单位在国际知名杂志如《Mol Cell》、《Circulation》、《Cell Metabolism》、《Nat Commun》、《J Hepatology》等IF10的论文10篇。实验室获得授权发明专利59项，其中一项获得国家专利优秀奖。

成果转化：实验室在国际上率先解决了FGF蛋白成药过程中的系列基因工程技术难题，研制出具有自主知识产权的三个国家生物制品一类新药(rFGF2, rhFGF2, rhFGF1)和一个III类(最高级别)医疗器械，为治疗严重创伤和难愈性溃疡提供了具有主动修复功能的创新药物，药物已经在全国2000多家医院使用，累计患者使用8000万人次。

形成以“长江学者”李校堃教授为学科带头人，人才梯队合理的高水平研究队伍。拥有“长江学者”特聘教授1人、国家优秀青年基金获得者1人、教育部新世纪人才1人、“新世纪百千万人才工程”国家级人选1人、国务院特殊津贴获得者2人、国家教学指导委员会委员3人；浙江省特级专家1人、“钱江学者”2人及浙江省卫生高层次创新人才、浙江省151人才、省中青年学科带头人等30余人。