2023年2月3日，浙江中医药大学第五临床医学院成立仪式在湖州市中心医院举行。湖州市中心医院是浙北地区规模最大的三级甲等综合性医院，一直以来重视医教研协同发展，与浙江中医药大学保持着长期的教学合作关系。浙江中医药大学第五临床医学院在湖州市中心医院挂牌成立后，双方将本着优势互补、互惠共赢的原则，在医院现代化管理、卫生领域高层次人才引育、医药卫生体制改革等方面开展积极探索，加快研究型医院战略布局和医研资源开放共享，为湖州高起点创建中医药综合改革先行区、高水平建设健康中国先行示范区建设提供强劲支撑。
2024年4月，第五临床医学院首次独立组织2024年临床医学专业硕士研究生招生复试工作，按照计划录取了25位学生，涵盖内科学、外科学、妇产科学、儿科学、放射影像学、神经病学、骨科学、麻醉学、肿瘤学、急诊医学、眼科学和临床病理十二个专业大类。
2024年4月12日，浙江中医药大学副校长黄建波一行赴第五临床医学院（湖州市中心医院）进行专题调研。医院将进一步从组织架构完善、师资培训、教学管理、学生关爱等方面进行完善，集全院之力推进第五临床医学院高质量发展。
湖州市中心医院始建于1931年，前身为浙江省立医院，2023年成为浙江中医药大学第五临床医学院。医院先后获全国文明单位、全国卫生系统先进集体、全国精神文明建设先进单位、全国节约型公共机构示范单位、全国公立医疗机构经济管理年优秀单位、全国医院医疗保险服务规范先进单位、全国综合医院中医药工作先进单位、浙江省抗击新冠肺炎疫情先进集体、浙江省先进基层党组织等荣誉，在全国三级公立医院绩效考核中位列A+。
2024年3月14日，浙江中医药大学教务处协同第二临床医学院组织校级教学督导专家对第五临床医学院床边教学工作进行了走访和督导。吴巍院长、胡鸿宇副院长和教学部相关工作人员全程参与了督导过程。本次走访旨在提升床边教学水平，进一步强化床边教学质量的同质化管理。