济南铁路管理局管辖范围为津浦铁路
德州(不含)以南至
浦口区段，
陇海铁路徐州至连云港区段，
胶济铁路、
淮南铁路全线及上述铁路区段内的支线。同年6月，管理局在
张店、
青岛、
徐州、浦口设铁路办事处。管理局内部机构设置基本保留原华东区铁路管理总局的机构框架，设有秘书、机务、运输、工务、材料、厂务、人事、会计、警务(后改为公安)等处。同年8月，撤销各办事处和临时管理委员会，成立
青岛、
徐州、
蚌埠铁路分局。1950年6月，郑州铁路管理局所辖
陇海铁路商丘(不含)以东至
徐州间139.900公里线路划归济南铁路管理局。10月成立
济南铁路分局。同时调整了各铁路分局管界。
1952年12月，津浦铁路838公里+000米处至浦口间的171.800公里线路，连同有关单位一并划归上海铁路管理局
管辖。1953年1月，局内管理机构调整为：车务、商务、机务、车辆、工务、电务、计划、财务会计、材料、人事、统计、卫生、教育、职工生活、总务、公安等处和行车安全监察室；后又增设基本建设、工程、劳动工资、客运、房建等处和局长办公室、总工程师室、人民监察室及运输计划、法律、技术、推先等科室。不久又撤销人民监察室、法律、推先科，将技术科
扩建为技术处。此间局机关共设26个处、科、室。同时，管理局将下属的具有管理职能的铁路分局改为铁路运输分局，改“块块”管理体制为“条块”结合的管理体制。铁路运输分局，只管理与运输生产有直接关系的车站、列车段、
机务折返段；其它单位由路局业务处管理；铁路运输分局对业务处
管理的基层单位实行业务联系和生产监督。1956年，又将铁路运输分局性质改为管理分局性质，使铁路分局具有“主管运输，协管其它”的职权。这种管理体制延续到1957年底。