永乐年间，惠帝撤藩，燕王
朱棣挥军入京，惠帝失踪，朱棣即位，是为成祖。二十年成祖励精图治，国泰民安。
王九租
捕头粟米的房开起
医馆，天命前来寻不死药，原来王九是当年医神农金匮的另一弟子王宵。
王九与前来讨租的粟米妹妹不足日久生情，可始终难忘已去世的天命之妻芍药。逃情路上遇昏迷的雷蕾带回医治，雷蕾的到来及其与王九的言行，令不足醋味十足。后雷蕾在感激众人的照顾下依依不舍的离去。王九与不足的感情有了发展。
平常在大家的动员下，刻苦习医与草堂一齐参加太医考劾，二人皆
被录取。身为太医的平常并不习惯官僚生活。
一姑发现草堂是自己的儿子，但在天命的威胁下不敢相认，原来当年有恩于一姑的农金匮抱其子被追后，一姑感恩将二子对换，平常实则是医神农金匮之子！草堂得知后却不愿接受事实，后一姑为救草堂而死。幸福之父竹利义满率
日本武士前来，要协助蛰伏民间，图谋复位的惠帝推翻成祖！惠帝并收买了天命与草堂。