洞穴生物指的是在无光及弱光、相对恒温和潮湿的洞穴环境中生长、发育的生物群。根据生物的四界分类法，洞穴生物可划分为原核生物、真菌、低等植物及动物。原核生物包括蓝藻和细菌，蓝藻大多分布在洞口或弱光带，细菌分自养型和异养型。在洞穴深部生活的是化能自养型细菌和异养型细菌，光能自养型细菌生活在有光地带，真菌同异养型的细菌，靠分解动物的尸体和排泄的粪便为食。洞穴植物主要为分布在洞口和弱光带的低等植物，如蕨类、苔藓、地衣及藻类等，在一些旅游洞穴的深部，也生长有灯光植物。20世纪中叶，在地质学、洞穴学和生物学的基础上，发展形成了一门相对独立的学科一洞穴生物学。
生活在洞穴中的动物。广义上也包括了经常进入洞穴，而有规律地返回地面(如蝙蝠，在北方寒冷气候时，在洞穴冬眠，在地面取食(如啮齿目中某些种的鼠)的动物。完全生活在洞穴中，为真正的穴居者。包括洞鲈科鱼、白色螯虾、洞源、穴蝰、盲甲虫、白色无眼扁形虫、双足类、等足类，兽类中的袋鼹科、鼹科、购科、囊鼠科、小犰狳等动物。由于洞穴与地面隔绝，受变化的气候影响小，洞道内环境相对恒定，同时洞内氧分压低，
二氧化碳分压高。穴居动物在形态、结构与生理功能上有其适应性表现：体型多为流线型、圆柱型，颈部不明显，前肢或门牙发达，这些特征便于打洞、钻洞；眼睛萎缩，视觉退化，色素减少，外壳或皮肤变薄；触觉器官伸长或变化；穴居兽无大耳廓，听力与发音独特地转向低频，以利声波在地下传播；有耐受低氧分压和高二氧化碳分压的整套生理适应机制与代谢机能。
双河洞地质公园洞穴系统内息着丰富的洞六生物，已发现的有洞穴多足虫(马陆)、水蛭、蝌、虾、蛙、蛛、蝙蝠、蟋蟀(斑灶马)、钩虾、大鲵、螃蟹菇等。为了适应洞穴无光、恒温、低能的特殊生态环境洞穴生物在生活习性和身体器管都发生了变异。在穴环境下，洞穴生物身体多为无色透明，且眼睛高度退化，但触觉却变得特殊灵敏，触须发达，如洞穴鱼类(盲鱼)和洞穴斑灶马(蟋蟀)是双河洞中最常见的洞牺生物，前者为无色透明，身体内各种器管清晰可见，而后者不但身体透明，而且触须发育，通常触须长度是其身体长度的4-5倍。
和洞外世界一样，洞内也有形形色色的生物，从肉眼看不见的细菌到大型的哺乳动物，在世界各地的溶洞里已相继发现。洞穴学家根据溶洞里的不同生态条件，把洞穴生物分为三大类：
洞穴生物的发现与研究，成为洞穴学的分支学科——洞穴生物学。经历了一个多世纪，这门学科才逐渐完善起来。欧、美各国还建立了相应的研究机构，发表了许多文章或专著，例如法国的噬洞穴动物志《欧洲洞穴动物群等。
至于我国的情况。作为洞穴学史来说，当然比欧、美早得多，若从明代徐霞客为一起点，距今已有300多年了。但是在洞穴生物学方面的研究就年轻多了。这是一种进展不平衡现象，只要我们加强调查研究，差距是可以缩小的，因为我国的洞穴生物无论在种类或者数量上，都是丰富多彩的。
洞穴生物只能在洞内特定环境中繁衍，在洞外已失去生存能力的生物，故又称真洞穴生物。如低等植物藻类、微生物、脊椎动物盲鱼、盲鳅，
无脊椎动物蜘蛛、马陆、班灶马、蜈蚣等。洞穴动物眼睛明显退化，缺乏色素，广义的来说是指洞内分布的所有生物种群。