波斯尼亚和黑塞哥维那联邦（Federacija Bosne i Hercegovine,Федерација Босне и Херцеговине），又称穆斯林和克罗地亚联邦，简称波黑联邦或穆克联邦。

波黑联邦拥有自己的首都、政府、旗帜、徽章、国家领导人、关税、警政部门、邮政系统以及航空公司（Air Bosna），亦有称为Vojska Federacije Bosne i Hercegovine的军队，但在2005年年底时双方决定合并各自的军队，现在波黑联邦及塞族共和国的军队皆隶于国家层级的波斯尼亚和黑塞哥维那防卫部门（Bosnia-Herzegovina Ministry of Defense）。

1994年5月华盛顿协定签署，成立波黑联邦。协定中提及联邦由克罗地亚族与波什尼亚克族所占领的地区组成，下分10州，采用州系统是避免有一族势力大过于其他族群。

1995年，联邦击败西波斯尼亚共和国，将其国土纳入联邦范围中。从签署岱顿协定后，波黑联邦成为波斯尼亚和黑塞哥维那两个政治实体之一，拥有51%的国土。2000年3月8日，布尔奇科成为拥有自治权的特区，由双方共治。

1.乌纳-萨纳州（Unsko-sanski kanton）

2.波萨维纳州（Posavski kanton）

3.图兹拉州（Tuzlanski kanton）

4.泽尼察-多博伊州（Zeničko-dobojski kanton）

5.波斯尼亚-波德里涅州（Bosansko-podrinjski kanton）

6.中波斯尼亚州（Srednjobosanski kanton）

7.黑塞哥维那-涅雷特瓦州（Hercegovačko-neretvanski kanton）

8.西黑塞哥维纳州（Zapadno-hercegovački kanton）

9.萨拉热窝州（Kanton Sarajevo）

10.西波斯尼亚州（Livanjski kanton）

其中乌纳-萨纳、图兹拉、泽尼察-多博伊、波斯尼亚-波德里涅、萨拉热窝等五州为波什尼亚克族州，波萨维纳、西黑塞哥维纳、西波斯尼亚为克罗地亚族州，其余中波斯尼亚、黑塞哥维那-涅雷特瓦两州为“混合”州，用来平衡各族群间的势力。

布尔奇科特区有一部份划自波黑联邦。

目前波黑联邦有79个市镇。

约51%的土地，60%的人口以此为家。但所有人口的相关资料（包括族群分布），因缺乏官方的人口普查而有相当大的误差。2002年估计联邦内人口约有两百五十万人，其中波什尼亚克族占70%，克罗地亚族占28%，塞尔维亚族占1.4%。而在1991年，当地波什尼亚克族占52.1%,克罗地亚族占22.1%%，塞尔维亚族占17.6%。联邦内塞尔维亚族在1991年后因内战爆发，人口大幅度衰退。

波黑联邦设一位总统，两位副总统。就像塞族共和国一样，职位由各族轮流担任。现任的总统为克罗地亚的尼克·罗赞季奇（NikoLozančić），属于克罗地亚民主联盟（Croatian Democratic Union of Bosnia and Herzegovina, HDZ），另外两位属于民主行动党（PartyofDemocraticAction,SDA），分别是穆斯林的萨巴兹·济汉诺维奇（Sahbaz Džihanović）和塞尔维亚族的德斯尼卡·拉迪沃耶维奇（Desnica Radivojević）。

内阁成员16人，现任内阁中8位是波什尼亚克族、5位是克罗地亚族，其余3位是塞尔维亚族；总理为波什尼亚克族的艾赫迈特·哈济兹帕希奇（Ahmet Hadžipašić），属于民主行动党。议会分为上下两议院，众议院有98个席位、参议院则由各州议会派遣的成员组成。与众不同的是，联邦中许多公用事业和行政系统如：电话、邮政、军队等等都被分为波什尼亚克族及塞尔维亚族两种，但最近其中许多单位又都重新合并成为单一的公营事业