理学院由数学系和物理学系组成。设有
控制科学与工程博士后科研流动站、系统工程博士点和9个硕士点：基础数学、概率论与数理统计、应用数学、计算数学、
运筹学与控制论、系统工程、
物理电子学、光学工程、
微电子学与固体电子学，其中系统工程为江苏省重点学科、控制科学与工程为江苏省重点一级学科。现有3个本科专业（5个方向）：
信息与计算科学、
数学与应用数学、数学与应用数学（师范）、数学与应用数学 （中外合作办学）、物理学（师范类），其中，数学类专业为江苏省重点专业类，信息与计算科学为江苏省特色专业。2011年与
美国阿卡迪亚大学合作，招收
数学与应用数学专业（中外合作办学），启动了与美国阿卡迪亚大学在人才培养和科学研究等方面的合作。在院本科生670人，博士、硕士研究生201人，博士后在站人员16人。
学院设有数学系、物理学系、大学物理实验中心（省级实验示范中心）、数学建模中心实验室、能源发展与环境保护战略研究中心（江苏高校哲学社会科学重点研究基地）、非线性科学研究中心、虚拟光学研发中心、数学研究所、应用物理研究所、应用概率统计研究所、计算数学研究所、运筹控制研究所、
系统工程研究所、超声检测研究所、非线性科学国际杂志编辑部和数学教育研究编辑部等教学科研机构，是镇江市数学学会和镇江市物理学会理事长单位。
现有教职工近150人，其中特聘院士1人、博士生导师9人，教授、副教授等高级职称60人。先后涌现了全国优秀教师、国家百千万工程人选、国家级优秀青年骨干教师、省“333”工程第二层次人选、省“青蓝工程”学术带头人、省“六大人才高峰”高层次人才、省优秀教育工作者、中国科学院院长特别奖获得者、钟家庆数学奖获得者等一大批人才。有20多位国内外著名专家被聘为学院兼职教授。
学院教学、科研成果丰硕。获江苏省教学成果一等奖1项、二等奖1项。有7门课程被评为省优秀课程、精品课程，由理学院教师指导的高等数学、数学建模、大学物理、科技创新挑战杯等大学生竞赛多次获得国际、全国和江苏省一等奖。学院公开发表科研论文近900篇，被SCI、EI、ISTP三大检索收录的论文有360多篇，出版专著30多本，主持
国家自然科学基金项目30多项、省部级项目50多项，获江苏省科技进步一等奖1项、部省级二等奖5项。2009年获江苏大学SCI论文发表先进单位，2010年
国家自然科学基金立项数居全校第一。
理学院坚持以教学为中心，以育人为根本，教学质量优良。学院有九门江苏省优秀课程：高等数学、大学物理、大学物理实验、理论力学、材料力学公共课程和物理专业的光学、中学物理教学法。一门校级优秀课程：线性代数；涉及4门核心课程，专业基础课。物理和工程力学两个校实验中心在1999年以优异成绩通过省教委组织的评估验收。由理学院教师指导的高等数学、全国大学生数学建模、江苏大学物理、江苏省力学、全国大学生挑战杯等大学生竞赛多次在全国及江苏省获得一等或二等的好成绩。