解放后1954年，汕头市人民政府下设宗教事务科，1956年6月，成立汕头市宗教事务局。1958年4月，宗教局从市政府划出，并入中共汕头市委统战部，成为市委统战部宗教科（对外挂宗教局牌子）。

1966年“文化大革命”开始，宗教管理工作停止，宗教科干部下放五.七干校或外调。1973年3月，在汕头市委统战部成立党派宗教科，对外挂宗教局牌子。

1983年10月，撤消原地区宗教处，与原市委统战部宗教科合并为汕头市委统战部宗教科，管理全市的宗教工作。1986年底，汕头市委统战部宗教科对外挂汕头市宗教局牌子。

1988年7月，将中共汕头市委统战部宗教科划出，设立汕头市宗教事务局，列二级局，为市人民政府管理宗教事务的职能机构，市宗教局行政归口市委统战部管理。各县（市）除南澳外，潮阳、揭阳、揭西、潮州（市）、普宁、饶平、惠来、澄海等县（市）均成立宗教事务局。南澳县、达濠区、郊区、安平区、同平区、公园区、金砂区，由县（区）人民政府办公室配备1名专职干部主管宗教事务工作。

1992年8月，明确在各区委统战部内增设宗教事务局，对外加挂宗教事务局牌子，履行辖区宗教事务管理职能。

1996年，市宗教事务局改称为汕头市民族与宗教事务局，列二级局，行政归口市委统战部管理。

2001年，设置市委统一战线工作部（以下简称市委统战部，市民族宗教事务局与其合署办公），为市委主管统一战线工作的工作部门。2001年10月15日，下设民族宗教科，负责民族宗教具体事务。

2002年7月30日，汕头市机构编制委员会下发《关于设立汕头市民族宗教事务局的通知》（汕机编[2002]47号），将与市委统战部合署办公的市民族宗教事务局单独设置，主管民族宗教事务的市政府工作部门。

（一）贯彻执行中央和省有关民族、宗教工作的方针政策和法律法规，起草有关地方性法规、规章草案，拟订民族宗教政策措施并组织实施。

（二）负责协调推动有关部门履行民族、宗教工作相关职责，促进民族政策在经济发展和社会事业有关领域的实施，防范利用宗教进行非法、违法活动，抵御境外利用宗教进行渗透活动。

（三）研究提出协调民族、宗教关系的工作建议，协调处理民族、宗教关系中的重大事项，参与协调涉及民族、宗教因素的社会维稳工作，保障少数民族和宗教界的合法权益，维护民族、宗教领域的和谐稳定。

（四）负责组织指导民族、宗教政策和法律法规的宣传教育工作，组织协调城市涉及民族因素的重大庆典活动，依法履行宗教事务管理职责，依法保护公民宗教信仰自由和正常的宗教活动。

（五）指导民族、宗教团体依法依章开展活动，支持民族、宗教团体加强自身建设，推动民族、宗教团体开展爱国主义、社会主义、拥护祖国统一和民族团结教育，办理民族、宗教团体需政府帮助解决或协调的有关事务。

（六）依法管理民族、宗教方面的涉外事务，协调民族、宗教工作的对外交流与合作，参与涉及民族、宗教事务的对外宣传工作，组织指导民族、宗教团体开展对外友好交往。

（七）参与拟订少数民族人才队伍建设规划，协助有关部门做好少数民族干部的培养、教育和使用工作，帮助宗教团体做好宗教人士的培养教育工作。

（八）承办市委、市政府和上级有关部门交办的其他事项。

（一）办公室

负责机关文电、会务、财务、人事、机要、档案、信息、安全、保密、信访、监察、纪检、党务及政务公开等日常工作和行政事务。

（二）民族宗教一科

承办佛教、道教、伊斯兰教和五大宗教以外的宗教以及民间信仰事务管理工作，提出有关政策建议；指导佛教、道教、伊斯兰教和民间信仰活动场所依法依章开展活动，联系佛教、道教、伊斯兰教人士、民间信仰人士及信众，并做好相关工作；指导区、县宗教事务部门依法对佛教、道教、伊斯兰教、五大宗教以外的宗教以及民间信仰事务进行管理。

承办城市民族工作，协调处理城市民族关系，提出城市民族工作相关政策建议；承办涉及尊重少数民族风俗习惯的有关管理工作；协调处理涉及民族因素的突发事件，防范、制止境内外民族分裂分子渗透。

（三）民族宗教二科

承办天主教、基督教事务管理工作，提出有关政策建议；指导天主教、基督教团体、活动场所依法依章开展活动，联系天主教、基督教人士及信众，并做好相关工作；协调管理境外人士在本市的宗教活动，配合做好防范抵御宗教渗透和打击邪教工作；指导区、县宗教事务部门依法对天主教、基督教事务进行管理。