檀祗（369年～419年），字恭叔，高平郡金乡县（今
山东省金乡县）人。东晋名将，左将军
檀韶的弟弟，名将
檀道济的哥哥。
元兴三年（404年），跟随
刘裕讨伐
桓玄，并随其攻克京口（今江苏省镇江市），为建武将军府参军。刘裕进攻建康，在罗落桥与桓玄军队大战，叔父
檀凭之战死。檀祗接管檀凭之所领军队。随后，刘裕攻取建康，桓玄弃城西走江州。晋安帝以刘裕为镇军将军、徐州刺史。刘裕以檀祗为镇军将军参军，加号振武将军，随同
刘道规率兵追杀桓玄残部，每战克捷。
义熙元年（405年），
刘道规击溃盘据江陵的
桓振等，迎接晋安帝回到建康。当时，桓道儿、张靖、苻嗣等人活跃于涢水、沔水一带，刘道规派檀祗将他们全部平定，檀祗转龙骧将军、秦郡太守、北陈留内史。又任宁朔将军、竟陵太守，但没有接受。后来，
桓亮、
苻宏等桓楚残余势力，在湘州起事，杀害官吏。檀祗领兵讨伐，击破桓亮于长沙，杀死苻宏于湘东。不久，檀祗接替
庾悦为武陵内史，加号宁朔将军，封西昌县侯，食邑千户。
义熙五年（409年），檀祗入为中书侍郎。六年，
卢循率众进攻建康，檀祗作为辅国将军，领兵屯于西明门外作防守。不久，卢循西退。檀祗原本要率兵支援江陵，因病而没有成行。义熙八年（412年），檀祗转任右卫将军，出为辅国将军、宣城内史，转督江北淮南军郡事、青州刺史、广陵相，进号征虏将军，加节。
义熙十年（414年），反对刘裕专政的
司马国璠兄弟在北徐州边界聚众，并率领数百人偷偷渡过淮河，乘着夜色阴暗，成功潜入广陵城中，大呼直取官署。檀祗闻讯惊起，正要出门迎敌，但被贼人射中大腿而退还。檀祗于是下令打五更鼓声，让贼人以为快要天亮，贼人就会逃跑。司马国璠听到鼓声以为天亮了，于是都奔散。檀祗部众趁势追击，共杀了百多人，檀祗因此事降号建武将军。义熙十一年（415年），檀祗进号右将军。义熙十二年（416年），刘裕北伐，亡命之徒司马氏寇掠
涂中，秦郡太守刘基求救，檀祗分军讨伐，击斩司马氏。
义熙十四年（418年），
刘裕进封宋公，以十郡建宋国，诏命檀祗当宋国的领军将军，加散骑常侍。不过，檀祗性格倨傲豪纵，喜欢在地方上放纵无拘。对于进入宋国任职甚为不快，郁郁生病，而且放弃治疗。不久，在广陵病死，享年五十一岁。追赠散骑常侍、抚军将军，谥为威侯。