梅山海事处原名
交通部长江航政管理局南京分局梅山监督站，成立于1988年；1989年更名为
交通部南京长江港航监督局梅山监督站。2001年6月18日，随着全国水监体制改革，在原
交通部南京长江港航监督局梅山监督站、大胜关监督站及原南京市
雨花区、
江宁区、江浦县港航监督所部分人员基础上正式成立
中华人民共和国南京海事局梅山海事处，为中华人民共和国南京海事局派出机构。2004年7月1日，局实施海事执法管理模式改革，在原来基础上成立梅山海事处海事执法大队，实行一门两牌、合署办公；2005年12月13日，局进一步完善海事执法管理模式改革后，海事处和执法大队在地理位置上实现分离，梅山海事处不再同时挂梅山海事处海事执法大队牌子。
梅山海事处位于南京市雨花台区南京板桥汽渡管理处东侧，下设三山办事处和江宁办事处。全处现有职工25人，其中：正式职工21人、聘用编外合同工4人、执法管理类人员16人、囤船水手2人。处现有一座800平方的办公楼、配备囤船1艘、海事巡视车2辆。
梅山海事处地处江苏长江段最上游，与安徽马鞍山接壤，辖区范围为上界慈湖河口与乌江河口的联线，下界梅子洲洲头的垂直联线，水域全长38KM，陆域岸线73.2Km，管辖范围涉及南京市江宁区、雨花区、浦口区和建邺区的地域。主要负责辖区内的船舶进出港签证、船舶载运内贸危险货物申报审核、船舶在港作业备案审查等当场办理的海事行政许可、审批事项；对岸线、码头、作业点、服务区、修造船厂、加油站、靠泊船舶的安全停泊、作业、防污染、配员等实施监督检查；监督管理辖区内渡口渡船及“四客一危”船舶，按权限实施船舶安全检查；征收辖区内的
船舶港务费，并对靠泊船舶的水上交通事故和船舶污染事故进行调查取证，必要时实施海事行政处罚和行政强制。
梅山海事处辖区内有三条水道，分别为南京水道、凡家矶水道和乌江水道；有南京长江三桥和南京大胜关长江大桥（在建）两座；有板桥汽渡一道，渡船5艘，现年运送汽车62万辆、旅客140万人;各类作业码头泊位102座，其中千吨级以上码头42座，危险品码头2座，水上服务区1个、水上加油站、点7个；架空过江电缆1处、水下过江电缆5处；船舶修造厂、点28家；江心洲岛5个。辖区内有江宁滨江开发区、雨花开发区、宝钢梅山集团、
南京华润热电有限公司、南京清江油运集团、南京日全油脂有限公司、南京板桥汽渡、
南京永华船业有限公司、南京东佳船舶制造有限公司等大中型企事业单位；南京新秦淮河在辖区内流入长江，小型船舶可从辖区新秦淮河直达江宁、溧水和高淳地区。辖区内船舶进出繁忙,年进出船舶已由2002年的7000多艘次上升到2006年的17700多艘次,
货物吞吐量由2002年的300多万吨增加到2006年的1000多万吨，年征收船舶港务费现达到600万元。
几年来，梅山海事处坚持以水上安全监督管理为中心，深入开展“安全畅通文明”航段、“文明平安”渡运线、文明执法示范窗口创建活动，坚持两手抓，既严格管理，又优质服务，取得了良好的成绩。辖区安全形势持续好转，从2004年起连续2年辖区没有发生一般及以上事故。2004年，南京梅山海事处被江苏海事局授予“文明执法达标窗口”。