根际效应，是指植物根系的细胞组织脱落物和根系分泌物为根际微生物提供了丰富的营养和能量，使植物根际中的微生物数量和活性显著高于根外土壤的现象。根际碳水化合物、氨基酸、维生素等物质的种类和数量直接影响根际微生物的种类、数量和活性*因此植物种类不同，根际效应也不同。根际是指受植物根系活动的影响·在物理、化学和生物学性质上不同于周围土体的根表面的一个微域环境，一般指离根轴表面数毫米之内。其中影响最明显的是根际pH、氧化还原电位、微生物活性、养分及污染物浓度等。

在根际范围内,微生物的数量、pH值及氧化还原条件的变化、专性和非专性根系分泌物使植物根系产生对外界不良环境的适应性的反应。离根越近,效应愈明显。根际微生物的数量比相邻的非根际土壤中的微生物数量大,以“根土比”(R/S)表示。即根际土壤中微生物数量(R),与邻近非根际土壤中微生物数量(S)之比。这种比值相差数倍到数十倍,农作物多在5～20 : 1之间。根际微生物区系因受根系选择影响,组成的种类比非根际少,且各类群之间的比例也与非根际有很大差异。根际、根系分泌物为根际微生物提供了营养和能源,影响着它们的数量、组成和活性;根际微生物的代谢作用促进或抑制根营养的吸收和生长。