核材料许可证持有单位必须建立的对各类核材料进行数量平衡计算及实物盘存核算制度，用此来发现核材料管理上的问题，防止核材料被盗、破坏、丢失、非法转让和非法使用。
核材料许可证持有单位的专职机构必须制定实物盘存计划和工作程序，定期进行实物盘存。为保证盘存准确可靠，必须按核材料的种类及物理化学形态进行分类盘存，采取严格的措施，保证盘存质量。
许可证持有单位应建立原始记录及报告制度。核材料账目的原始记录要求清楚、正确、系统和完整。账目管理要求系统、准确、及时，要有专职的核材料统计人员具体负责统计工作。许可证持有单位应向核材料管制机构提交核材料账目及衡算报告。