2012年8月18日下午他乘坐的一架小型
飞机在该国中部马斯巴特市
机场附近坠海，其助手获救，但本人和两名飞行员生死不明。
18日晚报道，林炳智当时正搭乘一架私人小飞机从中部城市宿务飞往北部城市那牙，途中在马斯巴特市机场试图紧急降落时坠落到附近的
海湾。
菲内政部随后发表声明对此予以证实。该部在网上发表的声明说，18日下午5时许，林炳智所乘飞机向马斯巴特机场呼救，并要求紧急降落。然而，
飞行员未能将飞机降落到该机场，而是坠入附近的马斯巴特湾。
菲律宾
海岸警卫队比科尔区指挥官霍埃尔·加西亚表示，当地军方、警方和海岸警卫队已派遣联合搜救队到事发海域进行搜救，此外现场还有8艘摩托艇实施搜救。
菲律宾武装部队南吕宋司令部发言人赫内罗索·博利纳
上校当天晚些时候说，初步调查显示这架飞机可能是由于机械故障而坠落。事故发生后，林炳智的助手带伤逃出。截至记者发稿时，救援人员仍未发现林炳智和机上两名
飞行员的下落。