李凌干出身与早年经历不详，最晚在延祐年间就已从
高丽忠宣王在元，为盘缠别监，同僚无不致富，只有李凌干清苦自励。冬月，破衫单袴，从不私吞一钱。等到忠宣王流放吐蕃时，李凌干怀揣金子，偷偷跟着驿吏，献给忠宣王，忠宣王及从臣由此无困乏之苦。泰定二年（1325年）。忠宣王薨，李凌干奉
梓宫东归，号呼跋涉，勤苦备至。
忠肃王时，他由密直副使迁知司事、右常侍。元朝曾欲废高丽为直辖行省，李凌干与
金怡、全英甫等奏请于元廷，遂作罢。论功为一等，赏给父母妻子封爵，赐土地奴婢。历任监察大夫、佥议参理、政丞。
曹頔之乱，侍从
忠惠王，功在第一，赐铁券，封宁川府院君。及忠惠王被元朝逮捕，宰相、国老议欲上书，请赦王罪，李凌干却说：“天子闻王无道罪之，若上书论奏，是以天子之命为非而可乎？”
恭愍王时，李凌干任左政丞、领都佥议事。丁酉年（1357年），以门下侍中致仕，同年去世。