生产上的杂交棉种的生产方式主要有两类三种，即人工去雄授粉法和
不育系制种法（包括核不育一系两用法和质核互作三系不育系法）。
人工去雄授粉法。是生产杂交种的最主要方法，市场上销售和应用的品种90%以上是应用这种方法生产的。父母本均为普通的棉花品系。在开始授粉之前要清理底部已经开发的花蕾和自交成铃；在每天下午和第二天早上六时之前需要将即将开放的花蕾去雄并且在早六时离开制种田；离开制种田后要组织人员清理漏去雄的花蕾；要检查去雄是否彻底，有无遗漏雄蕊（米粒）；整个授粉结束后要连续一周清理无效蕾；要清理授粉期间产生的自交铃。
核不育一系两用法。这种方法母本田中可育株和不育株各占约50%，将母本田中的可育株和不育株兄妹交子代仍产生可育株和不育株各占约50%，这样可以生产母本；将母本田中的可育株拔除剩余不育株和父本（即恢复系）杂交，可以生产应用于生产的杂交种。
质核互作三系不育系法。所谓三系指不育系、保持系、恢复系三系。不育系和保持系杂交子代仍为不育系，这样可以生产母本；不育系和恢复系杂交，可以生产应用于生产的杂交种。这种方法中的不育系不育株率和不育度均为100%。
棉花是我国主要农作物，皮棉是纺织业的主要原料，纺织业是我国重要的创汇产业。在国家大力支持下，纺织工业快速发展，需棉量急剧增加。国内棉花满足不了企业需求，棉花进口量快速增加，06年进口364万吨，纺织业对皮棉需求量的加大必然拉动植棉面积的增加。
我国常年植棉面积在8000--10000万亩，长江流域90%以上种植杂交棉品种，基本实现杂交棉化，约需杂交棉种3000万斤；黄河流域棉区达30%，约需杂交棉种2400万斤；新疆棉区2007年播种面积达10万公顷，约需杂交棉种900万斤。杂交棉种年需求量稳定在7000万斤以上，并且随着棉农对杂交棉增产增收的逐步认识和国家及种业企业的大力推广，用量还将增加。
杂交棉种的市场销售价格一般在80--100元/公斤，随着生产企业的增多，销售价格将持稳或略有下降，而随着人工费用的增加，种子生产成本必将逐年上升，河北邯郸繁制的杂交棉种子成本价达55元/公斤，种子生产销售企业和各级经销商的利润空间变小。
应用不育系生产杂交种子，不用去雄直接授粉，节省人工，成本仅为35--40/公斤，如利用蜜蜂授粉生产杂交棉种子，成本将更低，种子生产销售企业和经销商的利润空间较大。