替代种又称等值种（equivalent species）。由于气候变化、海陆变迁等历史原因，或由于某种生物自原生境向外扩散过程中，遇到不同生境而形成新种的结果，形成了分布很不相同，但彼此亲缘关系密切、有共同起源的种。如我国东北分布的西伯利亚刺与青海、宁夏、内蒙古分布的白刺，以及新疆东部、河西走廊的泡泡刺，它们起源于白刺，出现了在分布上彼此相互替代。

替代种（vicarious species）在地理分布上彼此替代，而分类系统上相近，或生态习性相似的动物种和起源于同一始生种型的植物种。替代种的产生多由气候变化，海陆变迁等历史原因，或由种在传播过程中所遇环境条件的不同而形成，如江南的马尾松在华北被油松替代，北美洲的驯鹿和亚欧大陆的驯鹿互为替代种等。

替代种是由一个共同祖先派生出来的、特征相近的分类学单位，它们各自占据独立的小分布区，空间上相互替代，这种现象叫替代分布，这些种就是替代种。替代种的产生或者是由于气候变化，或者由于海陆变迁产生的地理隔离，也可能是在种的散布过程中遇到不同生态条件的分化而出现新的种型。例如中国华北的油松就是江南马尾松的替代种，冷杉属的替代分布。

替代种的产生或者由于气候的变化，或者由于海陆变迁所产生的地理隔离，也可能是在种的散播过程中遇到了不同的生态条件而分化出新的种型。新种型的发生在山区特别显著，因为山区具有多种多样的生境，容易产生地理隔离，有利于种的分化。例如槭树属的一系列替代种分布于亚洲东部，这与当地生态条件的多样性是分不开的。