司马丕（341年－365年3月30日），字千龄，河内温县（今河南省温县）人。东晋第六位皇帝（361年7月13日—365年3月30日在位），晋成帝司马衍长子，母为周贵人。

晋哀帝司马丕生于咸康七年（341年）。

咸康八年（342年），受封为琅邪王。同年，晋成帝去世，本应司马丕登基，但中书令庾冰因害怕失去权势，遂以司马丕年幼为由，拥戴司马丕叔父晋康帝登基，改元建元。

永和元年（345年），拜散骑常侍。

永和十二年（356年），加中军将军。

升平三年（359年），任骠骑将军。

升平五年（361年）五月，晋穆帝去世，皇太后褚蒜子下令说司马丕本来早就该登基为帝，他是皇室正统，如今没有人比他更适合当皇帝。于是司马丕登基。五月，司马丕登基后大赦天下，同时封弟弟司马奕为琅琊王。同年七月，将晋穆帝安葬在永平陵；九月，立妃子王穆之为皇后。

隆和元年（362年）正月，前燕将领吕护、傅末波攻陷小垒，兵临洛阳。正月十三日，推尊生母亲周氏为皇太妃，进升琅邪王司马奕为侍中、骠骑大将军、开府。四月，吕护再次侵犯洛阳。五月，司马丕派北中郎将庾希、竟陵太守邓遐率领水军救援洛阳。七月，吕护军退守小平津。十二月初一日，出现日食，司马丕下诏表示要减轻严峻繁琐的赋税，周详地商议法令，全部遵循减损之要。

兴宁元年（363年）二月，改元并大赦天下。三月，司马丕生母皇太妃周氏去世于琅邪府，皇帝奔丧，诏令司徒、会稽王昱总管内外众务。七月，将周氏下葬。九月，司马丕因皇子降生而再次大赦。

兴宁二年（364年）二月，司马丕亲自下田劳动以发展农业。三月，因为司马丕一向喜欢长生不老之术，按照道士传授的长生法，断谷、服丹药，侍中高崧谏道：“这不是好事情啊，陛下不应如此。”哀帝不听，结果服药后药性大发而不能听政，于是崇德太后褚蒜子摄政。司马丕先任命桓温扬州刺史，后又派人让其入朝为宰相，结果桓温不同意。

兴宁二年（364年）七月，司马丕下圣旨让桓温入朝，但八月，桓温到了赭圻后就筑城居住在那里，桓温的权势和野心暴露。

兴宁三年（365年）正月一日，皇后王穆之去世。二月丙申日（3月30日），司马丕在西堂去世，时年二十五岁。葬在安平陵。司马丕死后谥号为哀，和王皇后并葬于安平陵。

晋哀帝司马丕没有后嗣，皇太后下达诏令，让琅邪王司马奕继承帝位。

司马丕在位期间实行土断后，又在兴宁二年（364年）三月一日再次推行，史称“庚戌土断”或“庚戌制”。其主要精神是划定州、郡、县领域，居民按实际居住地编定户籍。这一政策有利于行政统一和节省开支。时哀帝下令各地检阅户口把800寓户口编入所在郡县，严行法禁，因364年3月1日是庚戌日，故此制亦称“庚戌制”。此制颁行后，彭城王司马玄隐匿5户，被查出后收付廷尉。在当时收效较大，但桓温死后，此法亦止。

隆和元年（362年），司马丕登基不久，下诏减轻田税，一亩只收二升。同年八月，司马丕令袁真运送五万斛米到洛阳，同年冬十月，赏赐大米给贫穷的人，每人五斛。

褚蒜子：“琅邪王丕，中兴正统，明德懋亲。”

《晋书》：“哀皇宽惠，可以为君，而鸿祀禳天，用尘其德。”

司马丕的书法很好，晋朝偏安一隅，多文墨之气，司马丕也有书法作品。《淳化阁帖》是中国最早的一部汇集各家书法墨迹的法帖，其中就收录了哀帝司马丕的书法真迹《中书贴》，于2003年上海博物馆斥资450万美元从美国著名古董收藏家安思远处购回。

父：晋成帝司马衍。

母：周贵人，晋成帝妃嫔，后因哀帝即位为皇帝，尊为皇太妃，兴宁元年（363年）三月崩于琅邪王府第。

弟：晋废帝司马奕。

皇后：王穆之，太原晋阳人，王濛之女，母为安国乡君爰氏。哀帝为琅邪王时，迎娶为王妃，即位后立为皇后，兴宁二年（364年）崩。

皇子，名不详，生于兴宁元年（363年）。由于《后妃传》称王皇后无子，此子应为嫔妃所生。又，哀帝死后并无皇子可继位，亦无其皇子的传记，此子应在哀帝死前便已夭折。

《晋书·卷八·帝纪第八》

《资治通鉴·晋纪》

晋哀帝司马丕的陵墓为安平陵，位于今江苏省江宁县鸡笼山之南，不起坟。《元和志·卷二十五·上元县》：哀帝丕安平陵“在县北六里鸡笼山南”。