显微镜座是南天小星座之一，也是12个在18世纪由法国天文学家尼古拉斯·路易斯·德·拉卡伊（Nicolas-Louis de Lacaille）划分的以科学器具命名的星座之一。其英文名Microscopium的词根源自希腊语。星座内的恒星几乎很难用肉眼观测，尤其是在北半球。星座的中心位置赤经20时50分，赤纬-36度，在摩羯座南方，天鹤座和人马座两座之间。星座内无亮度超过4等的星，有5等星14颗。

显微镜座在摩羯座南方，东临南鱼座和天鹤座，西接人马座，南靠印第安座，西南方向和望远镜座相接。拉卡伊把显微镜和望远镜这两种光学仪器放在一起，让它们一个放眼宏观世界，一个洞察微观世界。1922年，国际天文联合会确定，显微镜座的拉丁缩写为“Mic”。星座的边界1930年被确定。在赤道天球坐标系中，显微镜座的天区为赤经20h27.3m至21h28.4m，赤纬由-27.45°至-45.09°。北纬45°以南的地区都可以看到整个显微镜座。由于星座内最亮的星也不亮过4等，显微镜座在光污染下的天空中很难被肉眼观测到。

这个小星座是拉卡伊1752年确立的，它几乎没有显著的亮星。构成这个星座的恒星原本属于邻近的人马座，是人马座的后脚。John Ellard Gore所著的书中写道，古波斯天文学家阿尔苏菲（al-Sufi）曾在这一片区域观测到了恒星，但阿尔苏菲并没有记载它们的位置。拉卡伊在好望角进行了两年的观测，观测了超过10000颗南天恒星，并把它们编成了星表，同时划分了一些欧洲观测不到的天区，其中就有现在的显微镜座（当时被命名为le Microscope），以纪念启蒙时代。1763年，拉卡伊赋予了它们拉丁名字，显微镜座被命名为Microscopium。

显微镜座γ（璃瑜增一）代表了显微镜的目镜，目视星等达到了4.68等，是显微镜座中最亮的恒星。在其6.2亿年的生命周期中，大部分都是蓝白色的主序星，然而现在它已经膨胀并冷却成了一颗光谱型为G6III的黄巨星，直径是太阳的10倍。使用三角视差法可以得到其距离地球223±8光年。通过测量自行，有的天文学家推测，其很有可能在390万年前经过距太阳1.14光年至3.455光年的范围内经过。因为其质量为2.5倍太阳质量，有可能足以干扰到奥尔特云。

显微镜座α（璃瑜一）也是一颗老年黄巨星，目视星等为4.90等，光谱型为G7III。它距离地球400±30光年，已经膨胀到了17.5倍太阳质量。显微镜座α有一颗10等的伴星，在7.5厘米口径的望远镜中可见，不过这是一对光学双星，靠的这么近完全是巧合，而没有任何物理上的联系。

显微镜座ε（璃瑜二）是一颗视星等为4.7等的白色恒星，距离地球166±5光年，光谱型为A1V。

显微镜座θ1和θ2是一对双星，角距离相对较大，可以用肉眼分辨。它们都是白色的A型强磁光谱变星，有很强的金属线，和猎犬座α2型变星类似。

显微镜座还有许多著名的天体太过暗弱，肉眼不可见。如显微镜座AX，常常又被称为拉卡伊8760，是一颗距离太阳系只有12.9光年的红矮星。它的星等达到了6.68等，是天空中最亮的红矮星。显微镜座BO是一颗快速旋转的恒星，距离太阳218±4光年，直径约为太阳的80%，它的自转周期只有9小时7分钟，因此又有了个外号叫“快速麦克风（Speedy Mic）”。作为一颗活跃的恒星，它的耀斑十分显著，平均强度是太阳耀斑的100倍，并且相比于太阳，它主要在X射线和紫外波段辐射能量。显微镜座AT是一个双星系统，两颗星都是红矮星。该系统与另一颗星显微镜座AU比较接近，并且可能与其形成了一个非常大的三重系统，并可能存在着一个正在形成碎片盘的行星系统。这三颗恒星是最近的在太空中共同运动的恒星系统——绘架座β运动群的候选成员。

2003年，根据南部非洲天文学会的报告，由于显微镜座中的蒭藁型变星的观测数据不完整，迫切需要对他们的观测。它们中的两颗——显微镜座R和S——对业余的新手天文学家很有挑战性，而另外两颗，显微镜座U和RY，则更为困难。另一颗红巨星，显微镜座T，是一颗半正则变星，亮度在344天内由7.7等变化至9.6等。显微镜座DD的视星等为11等，是一个由光谱型为K2III的橙色巨星和进轨道白矮星组成的双星系统，较小的白矮星电离了巨星的星风。这个系统的金属丰度较低。加上它们在银道坐标系中的纬度较高，这表明这个双星系统起源于银河系的星晕。

HD 205739是一颗黄白色的光谱型为F7V的主序星，质量为1.22倍太阳质量，亮度为2.3倍太阳亮度。通过径向速度法测得这颗恒星有一颗类木行星，公转周期为280天。WASP-7是一颗光谱型为F5V的恒星，视星等为9.54等，质量为1.28倍太阳质量。它有一颗热木星WASP-7b，是通过凌星法发现的，公转周期为4.95天。HD202628是一颗类太阳恒星，光谱型为G2V，有一个半径为158到220AU的碎片盘。这个盘的内缘非常清晰空旷，表明很可能有一颗行星在距离恒星86至158AU的地方运行。

1756年，拉卡伊将显微镜座中10颗主要的恒星用拜耳命名法命名并编入星表，分别为α至ι。一颗被拉卡伊命名为Nu Indi的恒星原本被划归为印第安座，而另一位天文学家古尔德发现它其实在显微镜座，于是改名为Nu Microscopii。英国天文学家弗朗西斯·贝利认为γ星和ε星属于临近的南鱼座，但是后来的制图员并没有听从这种观点。在1725年的《大英帝国星表》中，英国天文学家、弗兰斯蒂德命名法的创始人约翰·弗兰斯蒂德（John Flamsteed）将现在分别称为显微镜座γ、HR8076、HR8110、显微镜座ε的四颗恒星命名为显微镜座1、2、3、4。在这个星座的边界内，有43颗恒星的视星等小于6.5等（理论上肉眼可见的最暗的恒星）。

英国天文学家帕特里克·摩尔（Patrick Moore）得出的结论是，业余观测者对显微镜座毫无兴趣，因为其中的深空天体实在是太黯淡了。

NGC 6925

NGC6925位于显微镜座α西北偏西3.7度。图1中的NGC 6925很不寻常，因为它具有椭圆星系的大小和形状，但是它也具有几乎是螺旋星系专利的尘埃带的银盘。这些特征有可能来自它和另一个星系，数十亿年来相互作用影响的结果。天文学家一直在侦测NGC 6925内的新星爆发，并且发现NGC 6925内的新星出现率超乎意外的高，11天出现了4颗。天文学家之所以对新星这么有兴趣，是因为新星是起源自白矮星的一种爆发现象，而且会有固定的最大亮度。所以，如果NGC 6925内的白矮星也是典型的白矮星，那么它的新星也应该和其它的星系的新星一样，具有标准的亮度，天文学家就可以用它们精准地计算出这些新星和星系NGC 6925的距离。然后再用这个测定的距离，去校准其它的距离指针，得到一套更精确的量天尺，来量测宇宙各种天体的距离。天文学家正试着去了解造成NGC 6925星系这种不寻常情况的原因。初步的研究显示NGC 6925这个巨大的椭圆星系，大约在1亿年前吞食了一个附近的螺旋星系。支持这个说法的证据是图1中黑色的尘埃带，通常在螺旋星系中才会有大量的尘埃存在。图1中不怎么亮的点就是球状星团，我们尚不能解释这些球状星团为何这么小。大部分的椭圆星系都有又多又亮的球状星团，但NGC 1316中却只有一些而已。这些观测到的球状星团的年龄非常老，不可能是因为最近和螺旋星系碰撞后形成的，其中的一种假说是这些球状星团是先前的螺旋星系所残存下来的。

天文学家们在计算NGC 6925的地址的时，最终还是发现了这个星系。大概在一亿年前，NGC 6925这个巨大的椭圆星系开始吞噬小的旋涡星系。一个证据便是这些暗色的尘埃是旋涡星系特有的。但是一些不可解释的东西——在图片中可以看见的小点——实际上，它们是球状星团。显然的，在一般的椭圆星系中，球状星团要比NGC 6925中多的多，亮的多。但是，如果这些星团是在旋涡星系的冲撞中产生的话，这些星团显得太老了。一个假设便是这些星团是在星系的冲撞中幸免下来的。

NGC6923

NGC6923位于NGC6925附近，是一个漩涡星系。

显微镜座超星系团

显微镜座超星系团是20世纪90年代初首次发现的一个超密度星系团，其组成部分Abell星系团3695和3696很可能受到引力束缚，而Abell星系团3693和3705在同一领域的关系尚不清楚。