昆明医科大学类器官研究院是昆明医科大学下属研究机构。

类器官研究院成立后将开展以病毒为主的病原菌研究，重点关注云南本地草本资源的应用机制，推动中草药的转化应用，同时加大临床转化力度，将研究力量向临床推动，并利用类器官推动交叉学科研究。希望依托研究院的成立吸引更多类器官研究领域的优秀个人和团队在昆医落地生根，能够培养更多本土、本校的类器官领域人才，促进国内国际的人才交流。

2023年3月29日，昆明医科大学类器官研究院在该校呈贡校区揭牌成立。