日本密宗，在唐代由中国传向日本，故又称唐密，又有东密和台密两大分支。流传于日本之唐密，因其是大日如来的真实言教，故称真言宗。开祖为弘法大师空海（公元774－835年），他将印度的前期、中期密教传入日本。又因以东寺为发源地，故称为东密，东密完全承袭唐密。台密，即“天台密教”之意， 由最澄（传教大师）创始，而台密体系是于最澄法子法孙继续赴唐留学而成。由此瑜伽密教盛行于日本。

日本密宗

唐贞元二十年（804），日本僧人空海大师来唐交流法，在长安青龙寺从惠果大师受金刚界、胎藏界两部秘法，并受传法大阿阇黎位。3年后回国，以平安（今京都）东寺为中心弘传密教，并建高野山金刚峰寺为传教“根本道场”,创立真言宗,以传金刚界密法为主，亦称“东密”。其教义与中国密宗略同，但重视空海的《十住心论》、《秘密宝钥》、《辩显密二教论》、《即身成佛义》等所含基本要义。镰仓时期，赖瑜创新义真言宗，认为大日如来的法身不说法，其化身说法，以和歌山根来寺为中心，现有真言宗丰山、智山两派；反对此说的为“古义真言宗”，以东寺和高野山为中心，现有高野山真言宗、真言宗山阶派，真言宗醍醐派、真言宗东寺派等。此外，又有日僧最澄、圆仁、圆珍等先后来唐交流天台宗和密宗教义，回国后在比睿山等地进行弘传，被称为“台密”，以传胎藏界密法为主。此派基本上可分为根本大师（最澄）派、慈觉大师（圆仁）派和智证大师（圆珍）派三个流派。由此瑜伽密教盛行于日本。