日本基督教各派的统称。日本总人口约1.27亿（2000年），基督徒约197.7万，约占总人口1.56％。其中新教有宗派146个，约53.8万人，独立宗派有36个，约28.1万人，圣公会有宗派1个，约6.2万人，天主教有宗派1个，约45.7万人，东正教有宗派2个，约2.6万人，新兴宗派有9个，约77.6万人。有2种语言的足本《圣经》译本，1种语言的非足本《圣经》译本。新教教会有：基督联合教会、基督复临安息日会、浸信会联会、福音信义会、神召会、日本圣洁会、基督徒弟兄会、日本基督徒联盟、宣圣会、日本改革宗教会等；独立宗派教会有：日本圣洁传道会、独立教会、耶稣之灵等；其他新兴教派教会还有耶和华见证会、统一教、摩门教等。因日本基督教教会大力兴办文化、教育、医疗等事业，在日本文化界影响很大。至2000年，有7812个教会。日本基督教有三派：天主教、东正教、新教。

1549年，天主教耶稣会创始人之一、西班牙传教士沙勿略将天主教传入日本。其时日本正处于藩侯割据、战事不息的战国时代，执掌军政大权的织田信长对抗佛教，对天主教的传播予以支持，天主教在西部沿海地区迅猛发展，教徒增至20万（1587年）。丰臣秀吉掌权后，对基督教实行禁止政策。江户时期，德川幕府采取锁国政策，基督教遭到镇压，许多教徒惨遭杀害，幸存者被迫转入地下，其发展至1639年以后因日本禁教而结束。19世纪中叶，在欧美炮舰政策的威胁下，幕府的锁国闭关政策被迫取消，基督教各派积极传教，天主教恢复并积极发展，但未得到政府承认，直到明治维新后逐渐取得合法地位。1891年，梵蒂冈在东京设立大主教区。现设2个大主教、16个主教区，有教堂977座，并设有天主教中央协议会作为天主教主教团的联络机构。绝大多数集中分布在东京、大阪等大城市以及南部九州等地。20世纪70年代以来，由于天主教徒大量移民至巴西等拉美国家和出生率下降等原因，天主教发展缓慢。

日本正教会（Japanese Orthodox Church）自治正教会之一。由俄罗斯正教会修士大司祭尼古拉（Nikolai，1836—1912）创立。1860年起，尼古拉在日本传教；1870年，任东京俄罗斯传教使团团长；1880年起，任主教；1905年，升为日本大主教。此时出现首批日籍正教神职人员。1945年前，日本正教会为俄罗斯正教会主教区所辖，后与莫斯科牧首公署中断关系，直至1969年恢复。1970年，获自治地位。其首脑由莫斯科牧首任命，称都主教。总部设于东京。辖主教区4个，堂区约100个。在东京办有神学院1所。出版刊物《正教信使》。为世界基督教协进会成员。

1859年，由美国圣公会传入日本，发展迅速。此后长老会、公理会、卫公理会、福音同盟会、浸礼会、圣洁教会等新教相继传入，至1939年，日本新教教徒达24万人。1940年日本军国主义政府发布宗教团体法，强制各教团合并统一，新教各教派联合组成日本基督教团。1889—1945年期间，日本以神道教为国教，基督教的发展受到限制。二战期间，美国麦克阿瑟将军曾派遣1000名传教士到日本，信徒人数逐年增多。1946年，日本新颁布的宪法保证信仰自由。此后，基督教各教派，尤其是新教各派得以迅速发展。1968年，为协调各教派，日本成立教会发展研究会。1969年，成立日本普世教会，其宗旨是促进各种信仰间的对话。新教各派的全国性联络机构是日本基督教协进会，为世界基督教协进会较活跃的成员。圣诞节是日本全国性节日。日本天主教、东正教、新教的新旧教会从事传教活动，大力兴办文化、教育、医疗等社会福利事业，开展宗教交流和宗教理论研究等活动。