新疆兵团医院（石河子大学医学院第二附属医院）坐落于
乌鲁木齐市青年路232号。正式成立于1982年，已发展成为集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的省级综合性
三级甲等医院。
医院不仅承担着
兵团、
自治区广大人民群众
保健的任务，还担负着兵团主要疑难危重疾病的诊治和
突发公共卫生事件的救治任务。几十年的艰苦奋斗，兵团医院誉满天山，先后荣获全国扶残助残先进单位，全国残疾人三项康复工作先进单位，全国三甲
医院感染工作先进单位，全国优秀价格监测定点单位，连续五年荣获自治区药品价格定点监测先进单位一等奖、连续三年荣获乌鲁木齐市医疗保险优秀定点医院和医疗保险先进单位，连续两年荣获优秀商业保险定点医院,荣获兵团、乌市文明单位等荣誉称号。
兵团医院有
国务院特殊津贴专家7人，教授、副教授38名，高级职称121人，中级职称209人，硕士生导师10人。有231人在国家、省、自治区、兵团各级学术团体、
保健委员会中担任主任委员、秘书长等，其中主任副主任委员25人、秘书长副秘书长4人、理事常委52人。医院设有30多个临床、医技科室和20多个专科门诊检查、
治疗处室，是石河子大学医学院第二附属医院、新疆医科大学教学医院。2005年到2010年上半年，医院门诊量
平均增长速度为15.96%，出院病人数平均增长速度为16.97%，病床使用率已达115.19%，病床周转次平均增长速度为15.67%，手术量平均增长速度为16.22%。医院始终
坚持“科学技术是第一生产力”，不断加大技术创新力度。
兵团医院在国内外刊物上发表学术论文600余篇，参加国际学术会议20余次，开展新
技术、新项目300多项，获得国家、自治区及兵团科技成果一、二、三等奖共40项，并设立了“兵团医院科研基金”和“兵团医院青年科研基金”项目。同时，开展的主动脉夹层支架植入术、肝脏良恶性肿瘤切除及射频治疗、胰
十二指肠切除术、门脉高压症手术、肝包虫外壳剥离术、阴式微创手术-非脱垂子宫阴式切除术、绿激光治疗前列腺增生、等离子体低温组织消融术及髋、
膝关节置换术、超声乳化加晶体植入术治疗白内障、特色中西医肛肠疾病的治疗、小儿麻痹矫治手术、
冠状动脉搭桥术、
心脏起搏器植入术、
心脏瓣膜置换术、冠状动脉支架置入术、射频消融术、房间膈缺损封堵术、经尿道镜气压弹道碎石术、腹腔镜下交通支静脉结扎术、椎间盘镜微创治疗腰椎间盘突出症手术、静脉溶栓、动脉溶栓、缺血性卒中急性期病因诊断、临床分型及规范治疗、
鼻窦内窥镜手术、生物细胞技术等一系列填补新疆空白的新
技术、新项目。
2008年，在国家、兵团的大力支持下，医院投资1.15个亿建成了
面积为34700平方米的16层综合医疗大楼，实现了物流自动化、管理信息化、信息处理数字化，是兵团医疗卫生系统单位建筑面积最大、单体投资最多的项目。2010，兵团医院内科综合楼正在积极有序的建设中。同时，医院把先进的医疗设备作为临床技术的保障，购置了飞利浦1.5T磁共振、16排螺旋CT机、德国西门子大型C臂X光机、瑞典金宝和德国费森血液透析机、美国瓦里安直线加速器及TPS计划系统、骨科手术导航系统、GEDR机、GE骨密度扫描仪、GE彩超、GE钼靶乳腺机、超声乳化仪、
绿激光、
钬激光、日本奥林巴斯电子腹腔镜、美国罗氏E170全自动电化学发光分析仪、日本奥林巴斯2700全自动生化仪、瑞士帝肯全自动酶免分析仪、法国西比亚全自动蛋白电泳仪、德国人工心肺机等近千台医疗设备，即将安装320排CT机及卫生部北京医院赠送的 PET-CT机。