一，东晋永和七年（351年），从苍梧郡分置出新宁郡，治新兴县（今广东新兴县城）新宁郡领临允、新兴、单牒3个县，属广州。

南朝宋元嘉年间（424～453年），郡治移至南兴县（治在今广东新兴县城东北5公里）。新兴县改名新城县。新宁郡管辖的县增至14个，分别是：博林、南兴、临允、甘泉、新城、单牒、龙潭、抚纳以及威平、平乡、城阳、威化、初兴、归顺县。

南齐时期（479～502年），新宁郡治移至博林县（今广东高要市博洞村）。

南朝梁普通四年（523年）设置新州，州治在新宁郡（郡治又移回新兴县），增置索卢县（县治在今广东新兴县集成镇夏卢村）属新宁郡。

隋开皇九年（589年），废除新宁郡。

二，天监二年(503年)，一说承圣二年，在海宁县治新置。郡名是赞美语吉利词，以新安郡及海宁县各取首字合成。普通五年(524年)，改属东扬州。永定二年(558年)，改名海宁郡，以治地为名。后以名重，复名新宁郡。治海宁县（安徽休宁县城东万安镇），领海宁、黟县、歙县、黎阳四县。陈天嘉三年（562），撤销新宁郡，并入新安郡。