1959年初，上海京剧院陈正薇等一批演员下放扬州。5月，扬州地委以这批演员为基础，从专区所属各市、县京剧团抽调一批演职员组建成扬州专区京剧团。扬州专署文化局副局长吴宪兼任团长。不久又从省内外陆续聘请了梁慧超、罗慧兰、尚明珠等进团。武生梁慧超闻名南北，兼工长靠短打，其擅演的《金钱豹》、《挑滑车》、《陆文龙》、《乾坤圈》、《十一郎》、《长扳坡》、《杀四门》、全部《马超》，人称“梁八出’；陈正薇、尚明珠、罗慧兰各自擅演剧目《风还巢》、《廉锦枫》、《玉堂春》、《锁麟囊》、《红娘》、《天女散花》、《别姬》等，以及他们联合演出的《大闹平山堂》（根据《宏碧缘》改编），在省内外公演，声誉大振。

1960年秋，该团一度易名扬州专区京剧二团，梁慧超、尚明珠等离团，遂从其分团中抽调刘继良、陈蓉芳、陈小燕等充实该团。此后一个时期，剧团致力于新剧目的学习、创作和演出。如《杨门女将》、《穆佳英挂帅》、《满江红》、《欧阳公主》、《黑旋风李适》、《三打白骨精》、《武则天》、《秋理传》、《柯山红日》、《社长的女儿》、《芦荡火种》等。1965年该团创作现代戏《伏虎》，参加江苏省京剧革命现代戏观摩演出大会。同年又与江苏省京剧院共建剧组参加华东区京剧现代戏观摩演出大会，均获好评。“文化大革命”期间，一度停演，也排演过“样板戏”。1976年后，传统剧目恢复演出，但演员阵容已弱。