恩格勒系统是德国分类学家恩格勒(A．Engler)和
勃兰特(K．PrantI)于1897年在其《植物自然分科志》巨著中所使用的系统，它是
分类学史上第一个比较完整的系统，它将
植物界分13门，第13门为
种子植物门，再分为
裸子植物和
被子植物两个亚门，
被子植物亚门包括
单子叶植物和
双子叶植物两个纲，并将
双子叶植物纲分为
离瓣花亚纲(古生花被亚纲)和
合瓣花亚纲(后生花被亚纲)。
恩格勒系统将单子叶植物放在双子叶植物之前，将合瓣花植物归并一类，认为是进化的一群植物，将柔荑花序植物作为双子叶植物中最原始的类群，而把
木兰目、
毛茛目等认为是较为进化的类群，把
豆目归为
蔷薇目下的一个科等等,这些观点为现代许多分类学家所不赞同。
恩格勒系统几经修订，在1964年出版的《植物分科志要》第十二版中，已把双子叶植物放在单子叶植物之前。共有62目，344科，其中双子叶植物48目，290科，单子叶植物14目，54科。药用植物学教材被子植物分类部分采用修订的恩格勒系统，但有的内容有变动。