微进化(microevolution)，又称种内进化，是由突变、遗传漂变、基因流和自然选择导致的等位基因频率的改变。

微进化是指由线性分支（如种族分支或新物种形成）或种系转换引起的发生在种内乃至新形成的各种变化。生物进化至少表现在两个层面： 以生物个体为进化基本单位的微进化（Microevolution） ， 以及物种以上以类群为进化单位的宏进化（macroevolution）。微进化是物种多样性的来源，而宏进化反映了更高的分类单元——类群的非均衡演化过程。

站在不同的层面上可能看到不同的进化现象。一类进化现象发生在物种层次或以下，比如群体的变异性、适应性变化、地理变异和成种事件等，称为微进化；另一类则是发生在物种层次以上，特别是新的更高分类群的起源、侵入新的适应区以及与此相关的关键性进化新特征的获得（如鸟的翅膀，哺乳动物的温血性等），称为宏进化。达尔文时代以来，人们一直在激烈地争论宏进化到底只是微进化的连续，还是与微进化无关，因而需要用一套不同的理论来解释。

拥有许多微进化证据的达尔文主义者坚定地支持渐变式的进化机制，而一些掌握宏进化证据的古生物学家和系统分类学家则相信自然界还存在跃变式的进化机制。其实，不应该将两者割裂开来，它们本身就是相互交织在一起的整体。