微生物转化是通过微生物细胞将复杂的底物进行结构修饰，也就是利用微生物代谢过程中产生的某个或某一系列的酶对底物特定部位（基因）进行的催化反应。
应用
微生物的酶系的作用，在抗生素功能基团中引进取代基.制成新的抗生素，从而达到：
（1）降低抗生素的毒副反应，扩大应用范围；
（2）改变某些抗生素的理化性质，使其溶解度、吸收和排泄得到改善；
（3）扩大抗生素的抗菌谱或增强其抗菌活性；
（4）制备用现代化学方法不能合成的抗生素衍生物。其基本制备方法是用完整的菌体系统、无菌体的或是提纯了的酶系对微牛物产生的抗生素进行分子改造。