《微生物学报》创刊于1953年，是由中国科学院微生物研究所、中国微生物学会主办的以微生物学基础研究和应用基础研究以及高技术创新为主的综合性学术刊物。

1953年，《微生物学报》创刊。

1956年，《微生物学报》由半年刊改为季刊。

1989年，《微生物学报》由季刊改为双月刊。

2014年，成为国家新闻出版广电总局第一批认定学术期刊。

《微生物学报》主要报道普通微生物学，工业、农业、医学、兽医微生物学，病毒学，免疫学以及与微生物学有关的生物工程等等方面的研究成果。

《微生物学报》主要供从事微生物学研究及与微生物学有关的科研人员、管理人员和大专院校师生阅读。

据2018年3月《微生物学报》官网显示，《微生物学报》第十届编委会顾问共有2人，编委共有59人。

编委：白逢彦、白林泉、陈保善、陈冠军、杜良成、段康民、方维焕、郭俊、郭志儒、何群、黄英、孔宪刚、李文均、李翔、李越中、李正西、刘钢、刘双江、刘湘涛、刘秀梵、刘玉乐、楼慧强、马文勃、仇华吉、饶贤才、邵一鸣、邵宗泽、孙怀昌、孙建和、孙明、陶勇、王磊、王平、王忆平、韦革宏、温廷益，夏春谷、夏咸柱、向华、谢建平、徐岩、杨汉春、姚斌、袁志明、张传溪、张辉、张惠展、张建中、张杰、张奇亚、张学贤、张耀平、赵立平、郑天凌、钟扬、周宁一、朱伟云、朱旭东、朱阳

据2018年3月《微生物学报》编辑部官网显示，《微生物学报》已发行到40多个国家和地区。

据2018年3月中国知网显示，《微生物学报》共出版文献6919篇。

据2018年3月中国知网显示，《微生物学报》被CA 化学文摘（美）（2014)）、JST 日本科学技术振兴机构数据库（日）（2013）、Pж(AJ) 文摘杂志（俄）（2014）、CSCD 中国科学引文数据库来源期刊（2017-2018年度）（含扩展版）、北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊（1992年第一版、996年第二版、2000年版、2004年版、2008年版、2011年版、2014年版）等收录。

据2018年3月中国知网显示，《微生物学报》总被下载1309776次、总被引66493次、（2017版）复合影响因子为1.261、（2017版）综合影响因子为0.823。

办刊宗旨

反映微生物学研究领域中最新成果，促进中国内外学术交流。